11.8: Гелевий промокання
- Page ID
- 5833
Гелевий блоттинг - це методика візуалізації певної підмножини макромолекул - білків, або фрагментів ДНК або РНК - спочатку присутніх у складній суміші. Кроки:
- Відокремити молекули за допомогою електрофорезу. Це робиться в гелі, який дозволяє молекулам мігрувати під впливом електричного поля.
- «Промокніть» їх нітроцелюлозним фільтром. З невідомих причин молекули щільно прилипають до фільтра і збережуть своє взаємне положення при заливанні рідиною на наступному етапі.
- Купайте фільтр розчином, що містить «зонд»: молекулу, яка буде поєднуватися конкретно з молекулами-мішенями; тобто той (ів), який ви шукаєте, і несе засіб візуалізації, наприклад радіоактивний або флуоресцентний маркер.
Південний Блот
Діаграма ілюструє процедуру виявлення фрагментів ДНК, що містять ту чи іншу послідовність. ДНК витягується з клітини і частково перетравлюється рестрикційної ендонуклеазою. Отримані фрагменти ДНК відокремлюються електрофорезом, а потім денатуруються з утворенням одноланцюгових молекул (SSDNA). Не змінюючи їх положення, відокремлені смуги SSDNA переносяться на нітроцелюлозний фільтр і піддаються впливу радіомаркованої кДНК або РНК. Якщо зонд виявить взаємодоповнюючі послідовності ДНК, він зв'яжеться з ними. Наявність зонда в певній смузі виявляється за допомогою авторентгенографії.
Ця процедура була розроблена Е.М. Південним і готовий продукт носить назву «Південний пляма». Ця ж основна процедура може бути використана і для розділення і візуалізації молекул РНК і білкових молекул. Як гумористичне продовження терміну «Південний плям», вони отримали назву «Північний» і «Західний» плями відповідно (Таблиця\(\PageIndex{1}\)).
Тип помазки | Молекули, розділені електрофорезом | зонд |
---|---|---|
Південний | SSDNA | кДНК або РНК |
Північна | денатурована РНК | РНК або кДНК |
Західний | Протеїн | Антитіла |