11.2: Полімеразна ланцюгова реакція
- Page ID
- 5854
Полімеразна ланцюгова реакція - це техніка швидкого «клонування» певного шматка ДНК в пробірці (а не в живих клітині, таких як кишкова паличка). Завдяки цій процедурі можна робити практично необмежені копії однієї молекули ДНК, навіть якщо вона спочатку присутня в суміші, що містить багато різних молекул ДНК.
Порядок дій
Щоб виконати ПЛР, ви повинні знати хоча б частину послідовності молекули ДНК, яку ви хочете повторити. Потім ви повинні синтезувати праймери: короткі олігонуклеотиди (що містять близько двох десятків нуклеотидів), які точно доповнюють послідовність на 3' кінці кожної нитки ДНК, яку ви хочете посилити. Зразок ДНК нагрівають, щоб відокремити його нитки і змішують з праймерами. Якщо праймери знаходять свої комплементарні послідовності в ДНК, вони зв'язуються з ними; синтез починається (як завжди 5' -> 3'), використовуючи оригінальну нитку як шаблон.
Реакційна суміш повинна містити всі чотири дезоксинуклеотидних трифосфати (DaTP, DCTP, dGTP, dTTP), а також ДНК-полімеразу. Це допомагає використовувати ДНК-полімеразу, яка не денатурується високою температурою, необхідною для відділення ниток ДНК. Полімеризація триває до тих пір, поки кожна новосинтезована пасмо не зайшла досить далеко, щоб утримувати ділянку, розпізнаний іншим праймером. Тепер у вас є дві молекули ДНК, ідентичні вихідній молекулі. Ви берете ці дві молекули, нагріваєте їх, щоб відокремити їх пасма, і повторюєте процес. Кожен цикл подвоює кількість молекул ДНК.
Використовуючи автоматизоване обладнання, кожен цикл реплікації може бути завершений менш ніж за 5 хвилин. Після 30 циклів те, що почалося як єдина молекула ДНК, було посилено більш ніж на мільярд копій (\(2^{30} = 1.02 \times 10^9\)).
За допомогою ПЛР зазвичай можна ампліфікувати достатню кількість ДНК з одного волосяного фолікула для типування ДНК. Деякі працівники успішно ампліфікували ДНК з однієї сперматозоїдів. Методика ПЛР навіть дозволила аналізувати ДНК з мікроскопа слайдів тканини, збережених роками раніше. Однак велика чутливість ПЛР робить забруднення сторонніми ДНК постійною проблемою.