13: Персонажі та коефіцієнти диверсифікації
- Page ID
- 4648
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
Багато еволюційних моделей постулюють зв'язок між видовими характеристиками та видобутком, вимиранням або обома. Ці гіпотези можуть бути перевірені за допомогою залежних від держави моделей диверсифікації, які чітко враховують можливість впливу характерів видів на їх темпи диверсифікації. Моделі, що залежать від держави, в даний час мають деякі потенційні проблеми, але існують методи боротьби з цими критиками. Загальна здатність залежних від держави моделей пояснювати широкі закономірності еволюційних змін ще належить визначити, але є перспективним напрямком для майбутніх досліджень.
- 13.1: Еволюція самонесумісності
- Деякі види покритонасінних рослин можуть уникнути самозапліднення через самонесумісність. У рослин з самонесумісністю процес, за допомогою якого сперматозоїд зустрічається з яйцеклітиною, переривається на певній стадії, якщо пилкові зерна мають генотип, такий же, як у батьківського. Це запобігає самозапліднення - а також запобігає статевому розмноженню рослинами, які мають однаковий генотип (и) у локусах, залучених до процесу.
- 13.2: Державна залежна модель диверсифікації
- Моделі, які ми розглянемо в цьому розділі, включають еволюцію рис та пов'язану з цим диверсифікацію родової лінії. У найпростішому випадку ми можемо розглянути модель, де характер має два стани, 0 і 1, і коефіцієнти диверсифікації залежать від цих станів. Нам потрібно змоделювати переходи між цими станами, що ми можемо зробити ідентично тому, що ми робили раніше за допомогою марковської моделі безперервного часу.
- 13.3: Розрахунок ймовірностей для залежних від держави моделей диверсифікації
- Для обчислення ймовірностей для моделей диверсифікації, залежних від стану, використовується алгоритм обрізки з розрахунками, які рухаються назад через дерево від кінчиків до кореня. Ми вже використовували цей підхід для отримання ймовірності для моделей народжування-смерті з постійною швидкістю на деревах, і це похідне схоже.
- 13.4: ML та Байєсівські тести для диверсифікації, залежної від держави
- Тепер, коли ми можемо обчислити ймовірність для моделей диверсифікації, залежних від стану, формулювання ML та байєсівських тестів слідує тій же схемі, з якою ми стикалися раніше. Для ML деякі порівняння вкладені, тому ви можете використовувати тести коефіцієнта ймовірності.
- 13.5: Потенційні підводні камені та як їх уникнути
- Найсерйознішим обмеженням державозалежних моделей в даний час є те, що вони розглядають лише відносно невеликий набір можливих моделей. Зокрема, описаний нами вище підхід порівнює дві моделі: по-перше, модель, де народжуваність і смертність є постійними і не залежать від стану характеру; по-друге, модель, де народжуваність і смертність залежать тільки від стану характеру.