Skip to main content
LibreTexts - Ukrayinska

12.S: Поза моделями народження-смерті (резюме)

  • Page ID
    4787
  • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

    У цьому розділі я обговорив моделі, які виходять за рамки моделей постійної швидкості народження-смерті. Ми можемо встановити моделі, де швидкість видоутворення змінюється залежно від класів або через час (або обидва). У деяких випадках дуже різні моделі передбачають однакову закономірність у філогенетичних деревах, що вимагає певної обережності, поки не будуть включені прямі дані про викопні копалини. Я також описав модель затяжного видоутворення, де видоутворення займає деякий час для завершення. Ця остання модель потенційно краще пов'язана з мікроеволюційними моделями видоутворення і може вказувати на плідні напрямки для поля. Ми знаємо, що прості моделі народження-смерті не фіксують багатство видоутворення та вимирання у дереві життя, тому ці моделі, що виходять за межі народження та смерті, мають вирішальне значення для зростання порівняльних методів.

    Виноски

    1: Незважаючи на те, що цей підхід вимагає топології, Morlon et al. (2011) показують, що їх ймовірність еквівалентна іншим підходам, таким як Nee та Maddison, які покладаються лише на час розгалуження та повністю ігнорують топологію. Це пов'язано з тим, що дерева з однаковим набором часу розгалуження, але різні топології мають однакові ймовірності за цією моделлю.

    назад до основного тексту

    Посилання

    Альфаро, М.Е., Ф. Сантіні, К.Брок, Аламілло, А.Дорнбург, Д. Л. Rabosky, Г. Карневале, і Л.Дж. Гармон. 2009. Дев'ять виняткових випромінювань плюс високий оборот пояснюють видове різноманіття у щелепних хребетних. Збірник наукових праць Національної академії наук 106:13410 —13414. Національна академічна академія наук.

    Бентон, М.Дж. 2009. Червона королева і придворний блазень: видове різноманіття та роль біотичних та абіотичних факторів через час. Наука 323:728 —732.

    Брок, К.Д., Л.Дж. Гармон, і М.Е. Альфаро. 2011. Тестування на тимчасові зміни темпів диверсифікації, коли вибірка є неповною та невипадковою. Сист. Біол. 60:410 —419. Преса Оксфордського університету.

    Койн, Дж. А., і Х. А.Орр. 2004. Видоутворення. Сінауер, Нью-Йорк.

    Кусімано, Н., і С.С. Реннер. 2010 рік. Уповільнення темпів диверсифікації від реальних філогеній може бути нереальним. Сист. Біол. 59:458 —464.

    Де Кейроз, К. 2005. Ернст Майр і сучасна концепція видів. Збірник наукових праць Національної академії наук 102:6600 —6607. Національна академічна академія наук.

    Емерсон, Б.К., і Н.Колм. 2005. Видова різноманітність може керувати видоутворенням. Природа 434:1015 —1017.

    Етьєн, Р.С., і Б.Хегеман. 2012 рік. Концептуально-статистична база адаптивних випромінювань з ключовою роллю залежності від різноманітності. Ам. Нат. 180: Е75—89.

    Етьєн, Р.С., і Дж. Росінделл. 2012 р. Продовження минулого протидіє тязі сьогодення: затяжне видоутворення може пояснити спостережувані уповільнення диверсифікації. Сист. Біол. 61:204 —213.

    Етьєн, Р.С., Хегеман, Т. Стадлер, Т. Азе, П.Н. Пірсон, А.Пурвіс, і А.Б. Філлімор. 2012. Різноманітність-залежність наближає молекулярні філогенії до узгодження з викопним записом. Проц. Біол. Наук. 279:1300 —1309.

    Етьєн, Р.С., Піго А.Б., Філлімор А.Б. 2016. Наскільки достовірно ми можемо зробити висновок про диверсифікацію, залежну від різноманітності, з філогеній? Методи Еколь. Ед. 7:1092 —109.

    Гьона, С. 2014. Висновок правдоподібності непостійних показників диверсифікації з неповною таксонною вибіркою. Лос Один 9:e84184.

    Хьюз, С., і Р. Іствуд. 2006 рік. Острівне випромінювання в континентальному масштабі: Виняткові темпи диверсифікації рослин після підняття Анд. Проц. Наталь. Акад. Наук. У. С. А. 103:10334 —10339.

    Джетц, В., і Р.А. Пірон. 2018 рік. Взаємодія минулої диверсифікації та еволюційної ізоляції з нинішньою небезпекою по всьому дереву життя земноводних. Нат Еколь Евол 2:850 —858.

    Ламберт, А., Морлон, і Р.С. Етьєн. 2015 рік. Реконструйоване дерево в лінійній моделі затяжного видоутворення. J. Математика. Біол. 70:367 —397.

    Лосос, Дж. Б., і Ф.Р. Адлер. 1995 р. Затуплені деревами? Узагальнена нульова модель для закономірностей організмального розмаїття. Ам. Нат. 145:329 —342.

    Лосос, Дж. Б., і Д.Шлютер. 2000 р. Аналіз еволюційного співвідношення виду — площа. Природа 408:847. Макмілліан Журнали ТОВ

    Мей, М.Р., і Б.Р. Мур. 2016. Наскільки добре ми можемо виявляти зміни диверсифікації-швидкості конкретної лінії? Імітаційне дослідження послідовних методів АПК. Сист. Біол. 65:1076 —1084.

    Моен, Д., і Х. Морлон. 2014 рік. Чому диверсифікація сповільнюється? Тенденції Ecol. Вид. 29:190 —197.

    Мур, Б.Р., Хонна С., М.Р. травня, Б. Раннала, і J.P. Huelsenbeck. 2016. Критично оцінюючи теорію та ефективність байєсового аналізу макроеволюційних сумішей. Проц. Наталь. Акад. Наук. У. С. А. 113:9569 —9574.

    Морлон, Х., Т.Л. Парсонс, і Дж.Б. Плоткін. 2011 рік. Узгодження молекулярних філогеній з викопним записом. Проц. Наталь. Акад. Наук. У. С. А. 108:16327 —16332. Національна академія наук.

    Філлімор, А.Б., і Т.Д. Прайс. 2008. Щільнозалежний кладогенез у птахів. Лос Біол. 6:е71.

    Пібус, О.Г., і П.Х. Харві. 2000 р. Тестування макроеволюційних моделей з використанням неповних молекулярних філогеній. Проц. Біол. Наук. 267:2267-2272.

    Рабський, Д.Л. 2014. Автоматичне виявлення ключових нововведень, зміни швидкості та різноманітності залежності від філогенетичних дерев. Лос Один 9:e89543. Публічна бібліотека науки ім.

    Рабський, Д.Л. 2013. Різноманітність-залежність, екологічне видоутворення та роль конкуренції в макроеволюції. Анну. Преподобний Екол. Евол. Ст. 44:481 — 502. щорічні огляди

    Рабський, Д.Л., 2017. Як змусити будь-який метод «провалитися»: БАММ при кенгуру суду помилкової еквівалентності.

    Рабоскі, Д.Л., і А.Х.Гурльберт. 2015. Видове багатство в континентальних масштабах переважає екологічні межі. Ам. Нат. 185:572 —583.

    Рабський, Д.Л., і І.Ю. Ловетт. 2008 р. Диверсифікація, залежна від щільності в північноамериканських деревних очертках. Проц. Біол. Наук. 275:2363 —2371.

    Робоський, Д.Л., Доннелан С.Л., Талаба А.Л., Ловетт І.Ю. Виняткова варіація серед ліній диверсифікації показників під час випромінювання найрізноманітніших хребетних клади Австралії. Проц. Біол. Наук. 274:2915 —2923.

    Руланц, К., Дж. Гоуер, М.Уілкінсон та ін. 2007. Глобальні закономірності диверсифікації в історії сучасних земноводних. Праці. Національна академічна академія наук.

    Розінделл, Дж., С.Дж. Корнелл, С.П. Хаббелл, і Р.С. Етьєн. 2010 рік. Затяжний видоутворення оживляє нейтральну теорію біорізноманіття. Еколь. Лист. 13:716 —727.

    Шлютер, Д. 2000. Екологія адаптивного випромінювання. Преса Оксфордського університету, Оксфорд.

    Сепкоскі, Дж. 1984. Кінетична модель фанерозойського таксономічного різноманіття. III. Постпалеозойські сім'ї і масові вимирання. Палеобіологія 10:246 —267.

    Слейтер, Дж., і Л.Дж. Гармон. 2013 рік. Об'єднання скам'янілостей і філогеній для порівняльного аналізу диверсифікації та еволюції ознак. Методи Еколь. Ед. 4:69 —702. Інтернет-бібліотека Wiley.

    Сукумаран, Дж., і Л.Лейсі Ноулз. 2017 рік. Багатовидовий коалесцирующій розмежовує структуру, а не види. Проц. Наталь. Акад. Наук. У. С. А. 114:1607 —1612. Національна академія наук.