Skip to main content
LibreTexts - Ukrayinska

9.10: Паліндроми

  1. Last updated
  2. Save as PDF
  • Page ID
    5687

    • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

    Паліндром - це послідовність букв і/або слів, яка читається однаково вперед і назад. «Стіл був я тут бачив Ельбу» - це паліндром. Паліндроми також зустрічаються в ДНК. Існує два типи.

    Паліндроми, що виникають на протилежних нитках одного і того ж ділянки спіралі ДНК

    альт
    Малюнок 9.10.1 Паліндром рестрикційних ферментів

    5' ГГКК
    3'     КГГ 5'

    Цей тип паліндрому служить мішенню для більшості рестрикційних ферментів. Графік показує паліндромні послідовності, «помічені» п'ятьма рестрикційними ферментами (названими синім кольором), які зазвичай використовуються в рекомбінантній роботі ДНК.

    Перевернуті повтори

    У цих випадках два різних сегмента подвійної спіралі читають однаково, але в протилежних напрямках.

    5' Агакан НТТТ КТ 3'
    3'     ТТТТ НННН Ага 5'

    Перевернуті повтори зазвичай зустрічаються в

    • ДНК, з якою зв'язуються транскрипційні фактори.

      Послідовність ДНК, показана вище, - це елемент глюкокортикоїдної відповіді, де n представляє будь-який нуклеотид. Факторами транскрипції часто є димери однакових білків гомодимерів, тому не дивно, що кожному члену пари потрібно «бачити» одну і ту ж послідовність ДНК в одній орієнтації.

    • ДНК багатьох транспозонів фланкується перевернутими повторами, такими як цей:

    • 5' ГГККАТКА АГ.. ~ 40 nt. CCATTGACT ГКТГ ГКК 3'
       3' КГТК ТГТК АКТГТ АКТГТ АКТГК АКТГ. ~ 40 nt.

    • Інвертовані повтори на будь-якому кінці ретровірусних послідовностей генів допомагають вставляти копію ДНК в ДНК господаря.
    • Дубльовані гени.

      Y-хромосома людини містить 7 наборів генів - кожен набір, що містить від 2 до 6 майже однакових генів - орієнтованих спина до спини або голови до голови; тобто вони перевернуті повторюють, як показано тут. (Тире представляють тисячі пар основ, які відокремлюють сусідні паліндроми.)

    КТК КАКАА ЗГАДУЄТЬСЯ TTG GTG... 3'

    GAGGGTGTGGT ТАКТ АСАК... 5'

    Така орієнтація та надмірність можуть допомогти гарантувати, що шкідливу мутацію в одній копії набору можна відновити за допомогою інформації в іншій копії цього набору. Все, що потрібно, це сформувати цикл так, щоб дві послідовності вишикувалися пліч-о-пліч. Потім можна зробити ремонт (ймовірно, за механізмом гомологічної рекомбінації). Ось, наприклад, єдина різниця в послідовностях може бути усунена (червона для синього або навпаки).