16.4: У кремнієвій ПЛР

Last updated

Oct 24, 2022
Save as PDF
- 16.3: У обмеженні кремнію
- 16.5: Грунт-вибух

$\newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} }$

$\newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}}$

$\newcommand{\id}{\mathrm{id}}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}$

$\newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}$

$\newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}$

$\newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}$

$\newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}$

$\newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}$

$\newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\id}{\mathrm{id}}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}$

$\newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}$

$\newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}$

$\newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}$

$\newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}$

$\newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}$

$\newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

Використовуючи послідовності праймерів, можна визначити розмір та/або розташування продукту ПЛР. Це можна зробити за допомогою BLAST або за допомогою такої програми, як UGENE.

Використання BLAST

Грунтовки для вставки ПВ92.
- Грунтовка вперед: 5 ′ GGATCTCAGGGGGGT GGCAA ATGCT 3 ′
- Зворотний ґрунтовка: 5 ′ GAAAG GCAA AG-ACA AGCCCAA 3 ′
Відвідайте ВИБУХ: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch.
Приклеюємо обидва грунтовки:
- GGT КЛІТКА GGGGGGT GG GCAAAAAAAAG GCAAG CCCAA
- Видаліть цифри 5′ і 3′.
Вибираємо «Дещо схоже».
- Знайдіть місце розташування виробу і розмір.

Використання Ugene

Вправа з використанням людського D-Loop праймерів.
- Переносний ґрунтовка 5'-TTAACTCCCATTAGCAT CACC-3'
- Грунтовка зворотна 5'-GAGGATGGGGGTCAAGGAC-3'
Завантажте зразок файлу Генбанку: Геном мітохондрій людини.
Відкрийте файл в Ugene.
Виберіть кнопку «In Silico PCR» в крайньому правому куті (кнопка подвійної спіралі).
- Вставте праймери вперед і назад у відповідні місця.

кнопка грунтовки

5. Продукт ПЛР слід зазначити для однієї з послідовностей після натискання «Знайти продукти в будь-якому випадку».