Skip to main content
LibreTexts - Ukrayinska

16.4: У кремнієвій ПЛР

  1. Last updated
  2. Save as PDF
  • Page ID
    6529

    • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

    Використовуючи послідовності праймерів, можна визначити розмір та/або розташування продукту ПЛР. Це можна зробити за допомогою BLAST або за допомогою такої програми, як UGENE.

    Використання BLAST

    1. Грунтовки для вставки ПВ92.
      • Грунтовка вперед: 5 ′ GGATCTCAGGGGGGT GGCAA ATGCT 3 ′
      • Зворотний ґрунтовка: 5 ′ GAAAG GCAA AG-ACA AGCCCAA 3 ′
    2. Відвідайте ВИБУХ: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch.
    3. Приклеюємо обидва грунтовки:
      • GGT КЛІТКА GGGGGGT GG GCAAAAAAAAG GCAAG CCCAA
      • Видаліть цифри 5′ і 3′.
    4. Вибираємо «Дещо схоже».
      • Знайдіть місце розташування виробу і розмір.

    Використання Ugene

    1. Вправа з використанням людського D-Loop праймерів.
      • Переносний ґрунтовка 5'-TTAACTCCCATTAGCAT CACC-3'
      • Грунтовка зворотна 5'-GAGGATGGGGGTCAAGGAC-3'
    2. Завантажте зразок файлу Генбанку: Геном мітохондрій людини.
    3. Відкрийте файл в Ugene.
    4. Виберіть кнопку «In Silico PCR» в крайньому правому куті (кнопка подвійної спіралі).
      • Вставте праймери вперед і назад у відповідні місця.

    кнопка грунтовки

    5. Продукт ПЛР слід зазначити для однієї з послідовностей після натискання «Знайти продукти в будь-якому випадку».