12.3: Материнське походження (активність)
- Page ID
- 6565
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
ПЛР-ампліфікація мітохондріальної контрольної області
У межах контрольної області мітохондрій є 2 гіперзмінні області. Ця вправа підсилює лише одне з них. Для отримання більш остаточних результатів обидва повинні бути посилені та послідовні. Ця вправа дозволить нам мати приблизне уявлення про походження нашої материнської лінії, і ми зможемо віднести себе до різних племен у всьому світі. Геном мітохондрій людини (файл генбанку).
Переносний ґрунтовка 5'-TTAACTCCCATTAGCAT CACC-3'
Грунтовка зворотна 5'-GAGGATGGGGGTCAAGGAC-3'
- ПЛР попередньо витягують зразки ДНК.
- Налити 2% агарози в ливарний апарат в холодильнику.
- Потрібно зробити 2 гелі на клас → 100 мл ТБЕ з 2г агарози
- Додайте безпечний розчин SYBR 5 мкл у розплавлену агарозу перед литтям.
- Помістіть 2 комплекти гребінців в гель → на одному кінці і посередині.
- Завантажте гель драбинкою ДНК і ПЛР.
- Запустіть гель при 120В протягом 20 хвилин.
- Візуалізуйте на ультрафіолетовому просвітнику.
- Документ з камерою для перевірки посилення.
- Інструктор подасть життєздатні реакції для секвенування.
- Аналізуйте дані під час сеансу Лабораторії біоінформатики.
- Використовуючи адресу електронної пошти NYCCT, зареєструйтесь для облікового запису за адресою https://dnasubway.cyverse.org/.
- Отримати еталонні мітохондріальні послідовності.
- Виконайте кілька послідовності вирівнювання за допомогою MUSCLE.
- Намалюйте філогенетичні дерева за допомогою PHYLIP та візуалізуйте за допомогою FigTree.