12.3: Материнське походження (активність)

Last updated

Oct 24, 2022
Save as PDF
- 12.2: Материнське походження
- 12.4: Вставка Alu (активність)

$\newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} }$

$\newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}}$

$\newcommand{\id}{\mathrm{id}}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}$

$\newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}$

$\newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}$

$\newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}$

$\newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}$

$\newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}$

$\newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\id}{\mathrm{id}}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}$

$\newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}$

$\newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}$

$\newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}$

$\newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}$

$\newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}$

$\newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

ПЛР-ампліфікація мітохондріальної контрольної області

У межах контрольної області мітохондрій є 2 гіперзмінні області. Ця вправа підсилює лише одне з них. Для отримання більш остаточних результатів обидва повинні бути посилені та послідовні. Ця вправа дозволить нам мати приблизне уявлення про походження нашої материнської лінії, і ми зможемо віднести себе до різних племен у всьому світі. Геном мітохондрій людини (файл генбанку).

Переносний ґрунтовка 5'-TTAACTCCCATTAGCAT CACC-3'

Грунтовка зворотна 5'-GAGGATGGGGGTCAAGGAC-3'

ПЛР попередньо витягують зразки ДНК.

Налити 2% агарози в ливарний апарат в холодильнику.
Потрібно зробити 2 гелі на клас → 100 мл ТБЕ з 2г агарози
Додайте безпечний розчин SYBR 5 мкл у розплавлену агарозу перед литтям.
Помістіть 2 комплекти гребінців в гель → на одному кінці і посередині.

Завантажте гель драбинкою ДНК і ПЛР.
Запустіть гель при 120В протягом 20 хвилин.
Візуалізуйте на ультрафіолетовому просвітнику.
Документ з камерою для перевірки посилення.
Інструктор подасть життєздатні реакції для секвенування.
Аналізуйте дані під час сеансу Лабораторії біоінформатики.
1. Використовуючи адресу електронної пошти NYCCT, зареєструйтесь для облікового запису за адресою https://dnasubway.cyverse.org/.
2. Отримати еталонні мітохондріальні послідовності.
3. Виконайте кілька послідовності вирівнювання за допомогою MUSCLE.
4. Намалюйте філогенетичні дерева за допомогою PHYLIP та візуалізуйте за допомогою FigTree.