Search

6: Нейтральне різноманіття та структура населення
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/06%3A_%D0%9D%D0%B5%D0%B9%D1%82%D1%80%D0%B0%D0%BB%D1%8C%D0%BD%D0%B5_%D1%80%D1%96%D0%B7%D0%BD%D0%BE%D0%BC%D0%B0%D0%BD%D1%96%D1%82%D1%82%D1%8F_%D1%82%D0%B0_%D1%81%D1%82%D1%80%D1%83%D0%BA%D1%82%D1%83%D1%80%D0%B0_%D0%BD%D0%B0%D1%81%D0%B5%D0%BB%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D1%8F
Тепер ми перейдемо до розгляду розбіжності між більш тісно пов'язаними групами населення. Думаючи про коалесценцію всередині популяцій, ми зробили припущення, що будь-яка пара родовищ однаково вірогід...Тепер ми перейдемо до розгляду розбіжності між більш тісно пов'язаними групами населення. Думаючи про коалесценцію всередині популяцій, ми зробили припущення, що будь-яка пара родовищ однаково вірогідна зливатися один з одним. Однак, коли існує структура популяції, це припущення порушується, оскільки батько алеля, ймовірно, буде виявлений у тій самій популяції, що і дитина, і тому родовища в різних популяціях рідше зливаються.
2: Частоти алелів та генотипів
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/02%3A_%D0%A7%D0%B0%D1%81%D1%82%D0%BE%D1%82%D0%B8_%D0%B0%D0%BB%D0%B5%D0%BB%D1%96%D0%B2_%D1%82%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%BE%D1%82%D0%B8%D0%BF%D1%96%D0%B2
У цьому розділі ми попрацюємо над тим, як основи менделівської генетики грають на рівні популяції в статево розмножуються організмах.
5: Популяційна генетика розбіжності та молекулярної заміщення
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/05%3A_%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_%D1%80%D0%BE%D0%B7%D0%B1%D1%96%D0%B6%D0%BD%D0%BE%D1%81%D1%82%D1%96_%D1%82%D0%B0_%D0%BC%D0%BE%D0%BB%D0%B5%D0%BA%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%80%D0%BD%D0%BE%D1%97_%D0%B7%D0%B0%D0%BC%D1%96%D1%89%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D1%8F
Більш загально, якщо наш нейтральний алель присутній в\(i\) копіях в популяції,\(2N\) алелів, ймовірність того, що цей алель стане фіксованим\(\frac{i}{(2N)}\), тобто ймовірність того, що нейтральний ...Більш загально, якщо наш нейтральний алель присутній в\(i\) копіях в популяції,\(2N\) алелів, ймовірність того, що цей алель стане фіксованим\(\frac{i}{(2N)}\), тобто ймовірність того, що нейтральний алель врешті-решт фіксується, просто задається його частотою ( \(p\)) в популяції. (Ми також можемо отримати цей результат,\(Ns \rightarrow 0\) ввівши Equation\ ref {eqn:prob_fixed}, результат, з яким ми зіткнемося пізніше.)
13: Ефекти пов'язаного виділення
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/13%3A_%D0%95%D1%84%D0%B5%D0%BA%D1%82%D0%B8_%D0%BF%D0%BE%D0%B2'%D1%8F%D0%B7%D0%B0%D0%BD%D0%BE%D0%B3%D0%BE_%D0%B2%D0%B8%D0%B4%D1%96%D0%BB%D0%B5%D0%BD%D0%BD%D1%8F
Генетичний дрейф - не єдине джерело випадковості в динаміці алелей. Алелі також відчувають випадкові коливання частоти через те, що вони присутні на наборі випадкових генетичних фонів з різною фітнесо...Генетичний дрейф - не єдине джерело випадковості в динаміці алелей. Алелі також відчувають випадкові коливання частоти через те, що вони присутні на наборі випадкових генетичних фонів з різною фітнесом.
7: Фенотипічна варіація та схожість між родичами
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/07%3A_%D0%A4%D0%B5%D0%BD%D0%BE%D1%82%D0%B8%D0%BF%D1%96%D1%87%D0%BD%D0%B0_%D0%B2%D0%B0%D1%80%D1%96%D0%B0%D1%86%D1%96%D1%8F_%D1%82%D0%B0_%D1%81%D1%85%D0%BE%D0%B6%D1%96%D1%81%D1%82%D1%8C_%D0%BC%D1%96%D0%B6_%D1%80%D0%BE%D0%B4%D0%B8%D1%87%D0%B0%D0%BC%D0%B8
Наприклад, ми розробили дві оцінки\(\widehat{\theta_{\pi}}\) та\(\theta\)\(\widehat{\theta_{W}}\), використовуючи очікування різних аспектів наших даних (попарне різноманіття та кількість розділених с...Наприклад, ми розробили дві оцінки\(\widehat{\theta_{\pi}}\) та\(\theta\)\(\widehat{\theta_{W}}\), використовуючи очікування різних аспектів наших даних (попарне різноманіття та кількість розділених сайтів відповідно). Таким чином, одна тестова статистика може бути прийнята \[D = \widehat{\theta_{\pi}} - \widehat{\theta_{W}}\] яка буде нульовою в очікуванні, якщо наші дані генеруються нейтральною моделлю постійної чисельності населення.
14: Взаємодія декількох вибраних локусів
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/14%3A_%D0%92%D0%B7%D0%B0%D1%94%D0%BC%D0%BE%D0%B4%D1%96%D1%8F_%D0%B4%D0%B5%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D0%BE%D1%85_%D0%B2%D0%B8%D0%B1%D1%80%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D1%85_%D0%BB%D0%BE%D0%BA%D1%83%D1%81%D1%96%D0%B2
Використовуючи це позначення та при деякій перестановці рівняння [eqn:hapfreq], отримаємо \[x_1' = \frac{x_1\bar{w}_1 - w_{14} c D}{\bar{w}}\] Тут ми припустили\(w_{23}=w_{14}\), що, тобто, що придатн...Використовуючи це позначення та при деякій перестановці рівняння [eqn:hapfreq], отримаємо \[x_1' = \frac{x_1\bar{w}_1 - w_{14} c D}{\bar{w}}\] Тут ми припустили\(w_{23}=w_{14}\), що, тобто, що придатність\(AB/ab\) людей така ж, як і\(Ab/aB\) індивіди (тобто, що придатність залежить лише від алелей, які переносяться індивідом, а не від того, яку хромосому вони переносять; це припущення іноді називається не цис -епістаз).
Популяційна та кількісна генетика (Coop)
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)
Ця книга була розроблена з мого набору нотаток для основної групи біології населення (PBGG) та класу бакалаврату населення та кількісної генетики (EVE102) в UC Davis. Завдяки Саймону Ешбахеру, Вінсу Б...Ця книга була розроблена з мого набору нотаток для основної групи біології населення (PBGG) та класу бакалаврату населення та кількісної генетики (EVE102) в UC Davis. Завдяки Саймону Ешбахеру, Вінсу Баффало, Ерін Калфі та Майклу Уітлоку, які читали та широко редагували попередні чернетки цих нотаток. Щоб проілюструвати ці нотатки, я використовував старі наукові та природничі ілюстрації, частково тому, що вони поза авторським правом, але головним чином тому, що вони приносять мені радість.
15: Вступ до математичних понять
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/15%3A_%D0%92%D1%81%D1%82%D1%83%D0%BF_%D0%B4%D0%BE_%D0%BC%D0%B0%D1%82%D0%B5%D0%BC%D0%B0%D1%82%D0%B8%D1%87%D0%BD%D0%B8%D1%85_%D0%BF%D0%BE%D0%BD%D1%8F%D1%82%D1%8C
1: Вступ
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/01%3A_%D0%92%D1%81%D1%82%D1%83%D0%BF
Ми також побачимо, як ці моделі неймовірно корисні для розуміння реальних закономірностей, які ми бачимо в еволюції фенотипів і геномів, таким чином, що більша частина нашого аналізу еволюції, в різни...Ми також побачимо, як ці моделі неймовірно корисні для розуміння реальних закономірностей, які ми бачимо в еволюції фенотипів і геномів, таким чином, що більша частина нашого аналізу еволюції, в різних областях від медичної генетики людини до збереження, базується на цих моделям. Тому популяційна та кількісна генетика є ключовими для розуміння різних прикладних питань, від того, як медична генетика визначає гени, що беруть участь у захворюванні, до того, як ми зберігаємо види від вимирання.
16: Бібліографія
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/16%3A_%D0%91%D1%96%D0%B1%D0%BB%D1%96%D0%BE%D0%B3%D1%80%D0%B0%D1%84%D1%96%D1%8F
9: Відповідь декількох рис на вибір
https://ukrayinska.libretexts.org/%D0%91%D1%96%D0%BE%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%96%D1%8F/%D0%93%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0/%D0%9F%D0%BE%D0%BF%D1%83%D0%BB%D1%8F%D1%86%D1%96%D0%B9%D0%BD%D0%B0_%D1%82%D0%B0_%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D1%96%D1%81%D0%BD%D0%B0_%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D1%82%D0%B8%D0%BA%D0%B0_(Coop)/09%3A_%D0%92%D1%96%D0%B4%D0%BF%D0%BE%D0%B2%D1%96%D0%B4%D1%8C_%D0%B4%D0%B5%D0%BA%D1%96%D0%BB%D1%8C%D0%BA%D0%BE%D1%85_%D1%80%D0%B8%D1%81_%D0%BD%D0%B0_%D0%B2%D0%B8%D0%B1%D1%96%D1%80
Фітнес організму залежить від результату багатьох різних організмних процесів і фенотипів. Таким чином, природний відбір часто діє на багато фенотипів узгоджено. У деяких випадках різні напрямки, які ...Фітнес організму залежить від результату багатьох різних організмних процесів і фенотипів. Таким чином, природний відбір часто діє на багато фенотипів узгоджено. У деяких випадках різні напрямки, які селекція намагається витягнути фенотипи популяції, можуть бути не всі можливі, щоб задовольнити всіх відразу. Такі компроміси фітнесу виникають, коли селекція суперечливо діє на генетичні корельовані фенотипи.