26.5: Пептиди

$\newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} }$

$\newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}}$

$\newcommand{\id}{\mathrm{id}}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}$

$\newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}$

$\newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}$

$\newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}$

$\newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}$

$\newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}$

$\newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\id}{\mathrm{id}}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

$\newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}$

$\newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}$

$\newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}$

$\newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}$

$\newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}$

$\newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}$

$\newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}$

$\newcommand{\Span}{\mathrm{span}}$

Клітини в нашому організмі мають хитромудрий механізм виготовлення білків. Людям доводиться використовувати інші методи, щоб синтезувати ті ж самі білки в лабораторії. Хімія синтезу пептидів ускладнена. Обидві активні групи на амінокислоту можуть реагувати, і послідовність амінокислот повинна бути специфічною для того, щоб білок функціонував. Роберт Мерріфілд розробив перший синтетичний підхід для виготовлення білків в лабораторії, ручний підхід, який був тривалим і нудним. Мерріфілд отримав Нобелівську премію з хімії в 1984 році за свою роботу. Однак сьогодні автоматизовані системи можуть вивернути пептид за дуже короткий проміжок часу.

Пептиди

Пептид - це комбінація амінокислот, в якій амінна група однієї амінокислоти зазнала реакції з карбоксильною групою іншої амінокислоти. Реакція являє собою реакцію конденсації, що утворює амідну групу $\left( \ce{CO-N} \right)$ , показану нижче.

Пептидний зв'язок - це амідний зв'язок, який виникає між амінним азотом однієї амінокислоти і карбоксильним вуглецем іншої амінокислоти. Отримана молекула називається дипептидом. Зверніть увагу, що конкретні бічні ланцюги кожної амінокислоти не мають значення, оскільки $\ce{R}$ групи не беруть участі в пептидному зв'язку.

Дипептид має вільну амінну групу на одному кінці молекули і вільну карбоксильну групу на іншому кінці. Кожен здатний продовжити ланцюг за рахунок утворення іншої пептидної зв'язку. Особлива послідовність амінокислот в більш довгій ланцюжку називається амінокислотної послідовністю. За умовністю послідовність амінокислот вказана в такому порядку, що вільна амінна група знаходиться на лівому кінці молекули, а вільна карбоксильна група - на правому кінці молекули. Наприклад, припустимо, що послідовність амінокислот гліцину, триптофану та аланіну утворюється з групою вільних амінів у складі гліцину та вільної карбоксильної групи у складі аланіну. Послідовність амінокислот може бути легко написана за допомогою абревіатур як Gyl-Trp-Ala. Це інша послідовність від Ala-Trp-Gly, оскільки вільні амінні та карбоксильні групи будуть знаходитися на різних амінокислотах у такому випадку.

Резюме

Пептид - це комбінація амінокислот, в якій амінна група однієї амінокислоти зазнала реакції з карбоксильною групою іншої амінокислоти.
Пептидний зв'язок - це амідний зв'язок, який виникає між амінним азотом однієї амінокислоти і карбоксильним вуглецем іншої амінокислоти.