Обчислювальна біологія
- Page ID
- 2862
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
- Книга: Буквар з обчислювальної біології (О'Ніл)
- Буквар для обчислювальної біології має на меті надати життєвим вченим і студентам навички, необхідні для досліджень у світі, багатому даними. Текст охоплює доступ та використання віддалених серверів через командний рядок, написання програм та конвеєрів для аналізу даних, а також надає корисну лексику для міждисциплінарної роботи.
- Книга: Обчислювальна біологія - геноми, мережі та еволюція (Kellis et al.)
- Цей текст охоплює основи алгоритмічного та машинного навчання обчислювальної біології, що поєднує теорію з практикою. Ми охоплюємо як основні теми обчислювальної біології, так і сучасні кордони досліджень. Ми вивчаємо фундаментальні методи, останні досягнення в цій галузі та працюємо безпосередньо з поточними масштабними біологічними наборами даних.
- Передня матерія
- 1: Вступ до курсу
- 2: Вирівнювання послідовності та динамічне програмування
- 3: Швидке вирівнювання послідовності та пошук бази даних
- 4: Порівняльна геноміка I- Анотація геному
- 5: Асамблея геному та вирівнювання всього генома
- 6: Бактеріальна геноміка—молекулярна еволюція на рівні екосистем
- 7: Приховані моделі Маркова I
- 8: Приховані моделі Маркова II-заднього декодування та навчання
- 9: Ідентифікація генів - генна структура, напівмарков, CRFS
- 10: Складання РНК
- 11: Модифікації РНК
- 12: Великі інтергенні некодуючі РНК
- 13: Мала РНК
- 14: Секвенування МРНК для аналізу експресії та виявлення стенограми
- 15: Регуляція генів I - Кластеризація експресії генів
- 16: Регуляція генів II - Класифікація
- 17: Регуляторні мотиви, вибірка Гіббса та ЕМ
- 18: Регуляторна геноміка
- 20: Мережі I- висновок, структура, спектральні методи
- 21: Нормативні мережі - висновок, аналіз, застосування
- 22: Взаємодія хроматину
- 23: Введення в стаціонарне метаболічне моделювання
- 24: Проект кодування- Систематичні експерименти та інтегративна геноміка
- 25: Синтетична біологія
- 26: Молекулярна еволюція та філогенетика
- 27: Філогеноміка II
- 28: Історія населення
- 29: Популяційна генетична варіація
- 30: Медична генетика - минуле до сьогодення
- 31: Варіація 2- Кількісне відображення ознак, EQTL, варіація молекулярних ознак
- 32: Особисті геноми, синтетичні геноми, обчислення в C проти Si
- 33: Особиста геноміка
- 34: Геноміка раку
- 35: Редагування геному
- Назад Матерія