4: Порівняльна геноміка I- Анотація геному
- Page ID
- 5092
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
У цьому розділі ми вивчимо нову область порівняльної геноміки, насамперед за допомогою прикладів вирівнювання геному декількох видів (робота, виконана лабораторією Келліса). Одним із підходів до аналізу геномів є висновок про важливі функції генів шляхом застосування розуміння еволюції для пошуку очікуваних еволюційних закономірностей. Інший підхід полягає у виявленні еволюційних тенденцій шляхом вивчення самих геномів. Разом, еволюційне розуміння та великі набори геномних даних пропонують великий потенціал для відкриття нових біологічних явищ.
- 4.6: МікроРНК (miRNA) генні підписи
- Як ми знаходимо еволюційні сигнатури генів miRNA та їх цілей, і чи можемо ми використовувати їх для отримання нових уявлень про їх біологічні функції? Ми побачимо, що це складне завдання, оскільки mIRNA залишають дуже збережений, але дуже тонкий еволюційний сигнал.
- 4.7: Регуляторні мотиви
- Інший клас функціонального елемента, який високо зберігається у багатьох геномах, містить регуляторні мотиви. Регуляторний мотив - це високо збережена послідовність нуклеотидів, яка зустрічається багато разів у всьому геномі і виконує певну регуляторну функцію. Наприклад, ці мотиви можуть характеризувати підсилювачі, промотори або інші геномні елементи.