Skip to main content
LibreTexts - Ukrayinska

2.14: Протеоміка

  • Page ID
    5915
  • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

    Геном

    Один повний набір генів в організмі (гаплоїдний набір).

    За винятком випадкових невідновлених пошкоджень його ДНК (= мутації), геном фіксується.

    транскриптом

    Найбільш поширене визначення: Всі молекули месенджерної РНК (мРНК) транскрибуються з генома.

    Варіюється в залежності від диференційованого стану клітини та активності факторів транскрипції, які включають (і вимикають) транскрипцію генів.

    Якщо говорити строго, то транскриптом можна визначити як усі молекули РНК, які включають в себе широкий спектр неперекладених, небілкових кодуючих РНК - транскрибуються з ДНК генома. Зараз вважається, що ~ 75% нашої ДНК транскрибується в РНК, хоча лише 1,5% цього є месенджерною РНК для синтезу білка.

    Метаболом

    Всі метаболічні механізми, наприклад,

    • ферментів
    • коферменти
    • дрібні метаболіти, як
      • проміжні продукти при гліколізі та клітинному диханні
      • нуклеотиди

    присутній в клітці в даний момент часу.

    Варіюється в залежності від диференційованого стану клітини і її поточної діяльності.

    Протеом

    Протеом є протетом в доповненні до генного дому. Це зовсім трохи складніше, ніж геном, оскільки один ген може породити ряд різних білків через

    • альтернативне зрощування РНК до месенджера (pre-MRNA)
    • Редагування РНК передмесенджерних РНК
    • приєднання вуглеводних залишків з утворенням глікопротеїнів
    • додавання фосфатних груп до деяких амінокислот в білку

    Хоча ми, люди, мабуть, маємо лише близько 21 тисячі генів, ми, ймовірно, робимо щонайменше в 10 разів більшу кількість різних білків. Переважна більшість наших генів виробляють попередньо МРНК, які альтернативно зрощуються.

    Вивчення протеоміки важливо, оскільки білки відповідають як за будова, так і за функції всього живого. Гени - це просто інструкція з виготовлення білків. Саме білки роблять життя.

    Набір білків всередині клітини змінюється

    • від одного диференційованого типу клітин до іншого (наприклад, еритроцитів проти лімфоцитів) і
    • від моменту до моменту, в залежності від діяльності клітини, наприклад,
      • підготовка до дублювання свого геному;
      • відновлення пошкоджень його ДНК;
      • реагуючи на новодоступний нутрієнт або цитокін;
      • реагуючи на надходження гормону