2.14: Протеоміка
- Page ID
- 5915
Геном
Один повний набір генів в організмі (гаплоїдний набір).
За винятком випадкових невідновлених пошкоджень його ДНК (= мутації), геном фіксується.
транскриптом
Найбільш поширене визначення: Всі молекули месенджерної РНК (мРНК) транскрибуються з генома.
Варіюється в залежності від диференційованого стану клітини та активності факторів транскрипції, які включають (і вимикають) транскрипцію генів.
Якщо говорити строго, то транскриптом можна визначити як усі молекули РНК, які включають в себе широкий спектр неперекладених, небілкових кодуючих РНК - транскрибуються з ДНК генома. Зараз вважається, що ~ 75% нашої ДНК транскрибується в РНК, хоча лише 1,5% цього є месенджерною РНК для синтезу білка.
Метаболом
Всі метаболічні механізми, наприклад,
- ферментів
- коферменти
- дрібні метаболіти, як
- проміжні продукти при гліколізі та клітинному диханні
- нуклеотиди
присутній в клітці в даний момент часу.
Варіюється в залежності від диференційованого стану клітини і її поточної діяльності.
Протеом
Протеом є протетом в доповненні до генного дому. Це зовсім трохи складніше, ніж геном, оскільки один ген може породити ряд різних білків через
- альтернативне зрощування РНК до месенджера (pre-MRNA)
- Редагування РНК передмесенджерних РНК
- приєднання вуглеводних залишків з утворенням глікопротеїнів
- додавання фосфатних груп до деяких амінокислот в білку
Хоча ми, люди, мабуть, маємо лише близько 21 тисячі генів, ми, ймовірно, робимо щонайменше в 10 разів більшу кількість різних білків. Переважна більшість наших генів виробляють попередньо МРНК, які альтернативно зрощуються.
Вивчення протеоміки важливо, оскільки білки відповідають як за будова, так і за функції всього живого. Гени - це просто інструкція з виготовлення білків. Саме білки роблять життя.
Набір білків всередині клітини змінюється
- від одного диференційованого типу клітин до іншого (наприклад, еритроцитів проти лімфоцитів) і
- від моменту до моменту, в залежності від діяльності клітини, наприклад,
- підготовка до дублювання свого геному;
- відновлення пошкоджень його ДНК;
- реагуючи на новодоступний нутрієнт або цитокін;
- реагуючи на надходження гормону