Skip to main content
LibreTexts - Ukrayinska

8.8: D1S80 VNTR (генотипування)

  1. Last updated
  2. Save as PDF
  • Page ID
    6504

    • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

    Міні-супутниковий маркер D1S80 розташований за адресою 1p35-p36. Цей ВНТР має довжину 16 основ. З варіацією алелів між 3-24 повторами, локус демонструє достатню різноманітність, щоб допомогти розрізняти людей. Хоча це не маркер CoDIS, для остаточної ідентифікації зразків необхідне використання декількох локусів. Великий повторення (16bp) дозволяє використовувати стандартний електрофорез агарозного гелю для вивчення різноманітності цього локусу в нашій лабораторії. Продукти ПЛР варіюються від 430 до 814 б.п.

    • D1S80 для: 5'-GAAACT GGCCTCC CAA ACT GCCG CCG-3 '
    • D1S80-об.: 5′ -ГТС ТТГТ ГАГАГАГАГАГАТ ТГ ГТГ ГК CCT ТГК-3 ′
    1. ПЛР зразки ДНК, витягнуті з щічних клітин за допомогою ПЛР-бісеру.
    2. Налийте 2% агарози в ливарний апарат в холодильнику.
      • Потрібно зробити 2 гелі на клас → 100 мл ТБЕ з 2г агарози
      • Додайте безпечний розчин SYBR 5 мкл у розплавлену агарозу перед литтям.
      • Помістіть 2 комплекти гребінців в гель → на одному кінці і посередині
    3. Завантажте гель драбинкою ДНК.
      • Зразок з ПЛР.
    4. Запустіть гель при 120В протягом 20 хвилин.
    5. Візуалізуйте на ультрафіолетовому просвітнику.

    Приклад результатів

    Файл: D1S80 Демо. PNG

    1. Скільки алелів видно в кожній смузі?

    2. Чи відрізняються генотипи між особинами?

    3. Чи є якісь з алелів спільними між окремими зразками?