10: Транскрипція та обробка РНК
- Page ID
- 6054
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
- 10.1: Вступ
- Транскрипція, синтез РНК на основі шаблону ДНК, є центральним етапом Центральної догми, запропонованої Криком в 1958 році. Основні етапи транскрипції такі ж, як і для реплікації: ініціація, подовження і припинення. Відмінності між транскрипцією у прокаріотів та еукаріотів полягають у подробицях.
- 10.2: Огляд транскрипції
- Всі клітини утворюють три основних види РНК: рибосомальну РНК (рРНК), трансферну РНК (тРНК) і месенджерну РНК (мРНК). рРНК є структурним, а також ферментативним компонентом рибосом, синтезуючої білком машини в клітині. Кількісно РРНК є найпоширенішими РНК у клітині та мРНК, найменше. Три РРНК і близько 50 рибосомних білків складають дві субодиниці бактеріальної рибосоми, як показано нижче.
- 10.3: Деталі транскрипції
- Деякі білки зв'язують ДНК, щоб регулювати транскрипцію, індукуючи або замовчуючи транскрипцію гена. Їх роль в регуляції експресії генів ми обговоримо пізніше. Інші білки взаємодіють з ДНК просто для забезпечення транскрипції. Вони включають один або кілька, які разом із самою РНК-полімеразою повинні зв'язуватися з промотором генів, щоб ініціювати транскрипцію.
- 10.4: Деталі обробки еукаріотичної мРНК
- Первинні стенограми еукаріотичної мРНК проходять велику обробку, включаючи сплайсинг, укупорку та поліаденілювання. Описані тут кроки розглядаються в порядку (іноді перекриття!) виникнення. Ми починаємо з зрощування, явища мРНК.
- 10.5: Обробка рибосомної РНК в ядрах еукаріотів
- У більшості еукаріотів великий ген рРНК у більшості еукаріотів транскрибує транскрипт попередника 45S, що містить (від найкоротшої до найдовшої) 5,8S рРНК, 18sRNA та 28S рРНК. «S» означає Сведберг, біохімік, який розробив техніку ультрацентрифугування швидкості осідання, щоб розділити молекули, такі як РНК, за розміром. Чим вище значення S, тим більша молекула і, отже, тим швидше вона рухається через в'язкий градієнт цукру під час центрифугування. РНК-полімераза I транскрибує 45S точність
- 10.6: Обробка тРНК в ядрах еукаріотів
- РНК-полімераза III також транскрибує гени тРНК з внутрішніх промоторів, але на відміну від генів 5S рРНК, гени тРНК, як правило, скупчуються в геномі. ТРНК складається в кілька петель шпильок, заснованих на утворенні внутрішнього Н-зв'язку між комплементарними основами в молекулі. 3'-термінальний залишок цієї (і кожної) тРНК зв'язується з амінокислотою, специфічною для тРНК.
- 10.7: Експорт РНК та рибосоми з ядра
- Синтез і обробка РРНК збігаються зі складанням рибосомних субодиниць, як показано нижче. Попередні РРНК 45S спочатку зв'язуються з рибосомними білками в ядрі (тому великому ядерному тілі!) ініціювати складання, а потім і служити каркасом для подальшого додавання рибосомних білків як до малих, так і до великих рибосомних субодиниць.
Мініатюра: Спрощена діаграма синтезу та обробки мРНК. (CC BY 3.0 - непортований; Кельвінсонг).