Skip to main content
LibreTexts - Ukrayinska

17.2B: Фізичні карти та інтеграція з генетичними картами

  1. Last updated
  2. Save as PDF
  • Page ID
    4699

    • Boundless
    • Boundless
    \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

    Фізичні карти відображають фізичну відстань між генами і можуть бути побудовані за допомогою цитогенетичного, радіаційного гібридного або послідовного відображення.

    Цілі навчання
    • Опишіть методи, що використовуються для фізичного відображення генів: цитогенетичне картографування, радіаційне гібридне картування та послідовне картування

    Ключові моменти

    • Фізичні карти надають вказану інформацію про кількість баз і фізичну відстань, яка існує між генетичними маркерами.
    • Цитогенетичне картування - це метод, який використовується для побудови фізичних карт, який використовує забарвлені ділянки хромосом для наближення відстані між генетичними маркерами.
    • Радіаційне гібридне картування - це метод, який використовується для побудови фізичних карт, який використовує випромінювання або рентгенівські промені для розбиття ДНК на фрагменти для визначення відстані між генетичними маркерами та їх порядку на хромосомі.
    • Послідовність відображення - це метод, який використовується для побудови фізичних карт, який використовує вже відомі місця генетичних маркерів для визначення відстаней у кількості пар основ.

    Ключові умови

    • цитогенетичні: або пов'язані з походженням і розвитком клітин
    • фізична карта: карта, яка показує, скільки ДНК відокремлює два гени і вимірюється парами основ
    • виражений тег послідовності: коротка підпослідовність послідовності кДНК, яка може бути використана для ідентифікації стенограм генів

    Фізичні карти

    Фізична карта забезпечує деталізацію фактичної фізичної відстані між генетичними маркерами, а також кількості нуклеотидів. Для створення фізичної карти використовуються три методи: цитогенетичне картування, радіаційне гібридне картування та послідовне картування. Цитогенетичне картування використовує інформацію, отриману шляхом мікроскопічного аналізу забарвлених ділянок хромосоми. Визначити приблизну відстань між генетичними маркерами можна за допомогою цитогенетичного картування, але не точну відстань (кількість пар основ). Радіаційне гібридне картування використовує випромінювання, таке як рентгенівські промені, для розбиття ДНК на фрагменти. Кількість випромінювання можна регулювати для створення менших або більших фрагментів. Ця методика долає обмеження генетичного картографування і не впливає на збільшення або зниження частоти рекомбінації. Картування послідовностей було отримано за допомогою технології секвенування ДНК, яка дозволила створити детальні фізичні карти з відстанями, виміряними за кількістю пар основ. Створення геномних бібліотек і комплементарних бібліотек ДНК (кДНК) (колекцій клонованих послідовностей або всієї ДНК з генома) прискорило процес фізичного картографування. Генетичний сайт, який використовується для створення фізичної карти за допомогою технології секвенування (сайт з тегами секвенування, або STS) - це унікальна послідовність в геномі з відомим точним хромосомним розташуванням. Виражений тег послідовності (EST) та поліморфізм довжини однієї послідовності (SSLP) є загальними STS. EST - це короткий STS, який ідентифікується з бібліотеками кДНК, тоді як SSLP отримують з відомих генетичних маркерів і забезпечують зв'язок між генетичними картами та фізичними картами.

    зображення
    Малюнок\(\PageIndex{1}\): Цитогенетична карта: Цитогенетична карта показує появу хромосоми після її фарбування та дослідження під мікроскопом.

    Інтеграція генетичних і фізичних карт

    Генетичні карти надають контури, а фізичні карти надають деталі. Легко зрозуміти, чому обидва типи методів картографування геному важливі, щоб показати загальну картину. Інформація, отримана з кожної методики, використовується в комплексі для вивчення генома. Геномне картографування використовується з різними модельними дослідницькими організмами. Картування генома є постійним процесом; оскільки розробляються кращі методи, очікується більше досягнень. Відображення геному схоже на завершення складної головоломки, використовуючи кожен шматок доступних даних. Картографічна інформація, що генерується в лабораторіях по всьому світу, вноситься до центральних баз даних, таких як GenBank при Національному центрі біотехнологічної інформації (NCBI). Робляться зусилля, щоб зробити інформацію більш доступною для дослідників і широкої громадськості. Подібно до того, як ми використовуємо глобальні системи позиціонування замість паперових карт для навігації по дорогах, NCBI створив інструмент перегляду геному для спрощення процесу інтелектуального аналізу даних.

    Внески та віднесення