2.8: Переклад мРНК
- Page ID
- 7584
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
Як код, що міститься в мРНК, перекладається в білок?
Структура і функції переносної РНК
- ТРНК мають дві функції:
- Хімічно зв'язуватися з певною амінокислотою (ковалентною)
- Розпізнати специфічний кодон у мРНК (нековалентний), щоб його приєднана амінокислота могла бути додана до зростаючого пептидного ланцюга
Аміно-ацильні тРНК-синтетази
- Функція полягає в тому, щоб «зарядити» молекули тРНК; тобто хімічно зв'язувати певну амінокислоту з асоційованою молекулою тРНК.
|
|
|
|
|
|
|
|
Висновки:
- На амінокислоту припадає одна аміноацилттетаза тРНК (вони досить специфічні).
- Існує потенційно більше однієї тРНК на амінокислоту.
- Потенційно існує більше одного кодону на тРНК.
Структура тРНК
- 70-80 нуклеотидів довгих
- Сформувати ряд вторинних структур штока/петлі
- ТРНК синтезуються зі стандартними базами AGCU. Однак після синтезу можуть бути модифіковані кілька основ:
- Уридилат може бути метильованим для отримання тимідилату
- Уридилат може бути перебудований для отримання псевдоридилату (тобто рибози, прикріпленої до вуглецю 5 замість азоту 1).
- Гуанідилат може бути метильований в різних положеннях.
- Амінокислота приєднується на 3' кінці тРНК або до 2' гідроксилу або 3' гідроксилу.
- Аміноацильні тРНК синтетази класу I приєднують асоційовані амінокислоти до гідроксилу тРНК 2' (ПРИМІТКА: зазвичай гідрофобні амінокислоти)
- Аміноацильні тРНК синтетази класу II приєднують асоційовані амінокислоти до гідроксилу тРНК 3' (ПРИМІТКА: зазвичай гідрофільні амінокислоти)
Малюнок 2.8.1: тРНК
- Якщо ідеальне сполучення бази Watson-Crick було потрібно на кодоні/анти-кодон триплет, то 61 різних тРНК буде потрібно.
- Ми знаємо, що це не так, тому один антикодон тРНК повинен бути в змозі розпізнати кілька різних трійок кодонів мРНК.
- Це більше розпізнавання тРНК можливо завдяки «коливанню» взаємодії базової пари на третій основі в кодоні/першій базі в антикодоні:
Малюнок 2.8.2: Хитання кодону
Можливі «коливання» кодонової основи спарювання (крім Watson-Crick):
- У - Г
- I - С
- Я - А
- Я - У
- Де U, G, A і C можуть бути або в кодоні (мРНК), або антикодоні (тРНК)
- I (інозин) можна знайти в антикодоні.
Розпізнавання амінокислот аміноацильними тРНК синтетазами
- Здається, включає не тільки антикодоновий триплет, але і значні інші контакти (в основному за участю акцепторної області стовбура).
Рибосоми
- МРНК з її закодованою інформацією та окремі тРНК, завантажені їх амінокислотами, об'єднані взаємною спорідненістю до комплексу РНК-білків, який називається рибосомою.
- Швидкість синтезу білка рибосомою становить приблизно 3-5 амінокислот/хв.
- Наприклад, великий білок (наприклад, Титин, 30 000 амінокислот) займає 2-3 години, щоб зробити.
- Рибосоми складаються з окремих молекул рибосомальної РНК (рРНК) та понад 50 допоміжних білків із загальною прокаріотичною організацією малої субодиниці (30S) та великої субодиниці (50S).
Переклад мРНК на білки
- Синтез білка зазвичай розглядається в три етапи:
- Ініціація
- Подовження
- Припинення
AUG - сигнал ініціації в мРНК
- Першою подією стадії ініціації є приєднання вільної молекули метіоніну (Met) до кінця тРНК Met специфічною аміноацил-тРНК синтетазою.
- Існує щонайменше два типи тРНК Мет:
- тРНК і Мет: може ініціювати синтез білка (в AUG з кодоном)
- ТРНК Мет: може включати залишки Met під час безперервного синтезу білка (в AUG з кодоном)
- Метіонін тРНК синтетаза приєднує метіонін до обох молекул тРНК.
- Тільки метіоніл-тРНК і Мет може зв'язуватися з невеликою рибосомальною субодиницею, щоб почати процес синтезу білка.
- У бактерій формується аміногрупа метіоніну в метіонілтРНК і Мет.
- Met-tRNA i Met, разом з білково-GTP-комплексом і малою (30S) рибосомальною субодиницею зв'язуються з мРНК у певному місці, поблизу кодону ініціації AUG.
Ініціювання синтезу білка
- У більшості прокаріотів компонент РНК (16S рРНК) у малій субодиниці рРНК (30S) розпізнає і гібридизує до певної послідовності на мРНК, яка називається послідовністю Шина-Далгарно:
- Таким чином, послідовність Shine-Dalgarno є місцем зв'язування рибосом, який необхідний для початку перекладу.
- Зверніть увагу, що рибосома зв'язується не при стартовому кодоні AUG, а 5-10 нуклеотидів вище за течією.
- Послідовність Shine-Dalgarno може бути розташована в будь-якому місці в межах мРНК.
- Для формування комплексу ініціації 30S необхідна низка факторів ініціації, мет-тРНК i Met, мРНК і 30S (тобто компонент 16S) рибосомної субодиниці.
- Велика (50S рРНК) рРНК зв'язується разом з вивільненням факторів ініціації 1 і 2 та гідролізом GTP, утворюючи комплекс ініціації 70S:
Малюнок 2.8.3: Комплекси ініціації
Подовження
- У першій частині етапу подовження трансляції рибосома рухається вздовж мРНК, щоб позиціонувати залишок fMet до ділянки P (пептидильного сайту) у субодиниці 50S.
- Це дозволяє розташувати другий кодон мРНК в місці А (сайт аміноацил тРНК).
- Відповідна заряджена тРНК (з амінокислотою), задана другим кодоном, позиціонується в ділянці A субодиниці 50S.
- Наступне утворення пептидних зв'язків синтезується і тРНК в ділянці А (який ковалентно прикріплений до зароджується поліпептиду) транслокується на ділянку Р.
- Цей процес вимагає ГТП і білка фактора подовження G (прокаріоти).
- Процес повторюється.
Припинення
- При досягненні стоп-кодону поліпептид гідролізується подалі від останньої тРНК.
- Пептид вивільняється і рибосома зазвичай дисоціює.
- Цей процес вимагає GTP та трьох різних факторів припинення (TF; лише один необхідний у еукаріотів)