3.3: Ферментативна стадія
Ферментативна стадія має безліч учасників. До них відносяться вуглекислий газ, носій водню з воднем (NADPH), АТФ, рибулоза біфосфат (RubP, абоC5), а також Rubisco разом з деякими іншими ферментами. Все відбувається в матриксі (стромі) хлоропласту.

Головною подією ферментативної стадії єCO2 засвоєння зC5 в короткоживіC6 молекули. Асиміляція вимагає Рубіско як ферменту. Далі цей тимчасовийC6 розбивається на двіC3 молекули (PGA). Потім PGA братиме участь у складному наборі реакцій, які проводять NADPH і АТФ як джерела водню та енергії відповідно; і дає (через проміжну стадію PGAL) одну молекулу глюкози (C6H12O6) на кожні шість асимільованих молекулCO2. NADP+, ADP і Pi повернуться на світлу сцену. Цей набір хімічних реакцій повертає RubP, який запустить новий цикл засвоєння. Отже, всі реакції, описані в цьому пункті, є частиною циклу, який має назву «цикл Кальвіна» або «C3цикл» (тому що молекули C3 PGA тут найбільш важливі).

В цілому ферментативна стадія починається зCO2, NADPH, АТФ іC5 (RubP). Закінчується глюкозою (C6Н12 О6), НАДП+, АДФ, Рi і тим жеC5. При додаванні азоту і фосфору глюкоза віддасть всі інші органічні молекули (рис.3.3.3).

Підводячи підсумок, логіка фотосинтезу (рис.3.3.4) заснована на простій ідеї: зробити цукор з вуглекислого газу. Уявіть, якщо у нас є букви «s», «g», «u» та «a» і потрібно побудувати слово «цукор». Очевидно, нам знадобляться дві речі: буква «r» та енергія, щоб поставити ці літери в правильному порядку. Та ж історія відбувається і в фотосинтезі: йому знадобиться водень (H), який є «відсутньою літерою»,CO2 оскільки цукру повинні містити H, O і C.+ NADP/NADPH використовується як постачальник водню, а енергія - АТФ, який створюється за допомогою протонного насоса, і протонний насос починається, тому що світло допомагає концентрують протони в резервуарі.
