21: Прив'язка та асоціація
- Page ID
- 17717
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
Молекулярні асоціації лежать в основі біологічних процесів. Специфічні функціональні взаємодії присутні на кожному рівні клітинної активності. Деякі з найважливіших:
1) Білки, що взаємодіють з малими молекулами та іо
- Взаємодія ферменту/субстрату та каталіз
- Зв'язування ліган/рецепторів
- Хімічна трансдукція енергії (наприклад АТФ)
- Сигналізація (наприклад, нейромедіатори, цАМФ)
- Зв'язування з препаратом або інгібітором
- Антиген, що зв'язує антитіла
- Малі молекули та транспортування іонів
- Мб + О2 → Мбо2
- Іонні канали та транспортери
2) Взаємодія білка та білка
- Сигналізаційні та регулюючі мережі
- Рецептори, що зв'язуються з лігандами, активують рецептори
- GPCR зв'язують агоніста/гормон для трансмембранного сигналу трансдукції
- Збірка і функції мультибілкових комплексів
- Реплікація машини в реплісомі складається з декількох білків, включаючи ДНК-полімеразу, ДНК-лігазу, топоізомеразу, хеліказу
- Кінетохор організовує взаємодію хроматину та рухових білків, що розділяють сестринські хроматиди під час поділу клітин
3) Взаємодія білка та нуклеїнової кислоти
- Всі кроки в центральній догмі
- Прив'язка фактора транскрипції
- Машини для ремонту ДНК
- Рибозими
У всіх цих прикладах загальним потоком є макромолекула, яка зазвичай виконує конформаційні зміни під час процесу взаємодії. Конформаційна гнучкість і зміни ентропії під час зв'язування відіграють важливу роль в описі цих процесів.