9.5: Фосфорилювання спиртів
- Page ID
- 20801
Широке сімейство ферментів під назвою кінази каталізують перенесення фосфатної групи з ТП на спиртовий акцептор. Механістично спиртовий кисень діє як нуклеофіл, атакуючи електрофільний g-фосфор ТП і виганяючи АДФ.
Глюкоза фосфорилюється на першій стадії шляху гліколізу ферментом гексозакіназою (ЕС 2.7.1.1), утворюючи глюкозо-6-фосфат.
Механізм гексози кінази
Ось стенографічний спосіб зобразити цю реакцію. Зверніть увагу на позначення «ATP in, ADP out», що використовується нижче, що вказує на те, що АТФ є одним з реагентів, а ADP є одним із продуктів. Звідси ми часто будемо використовувати цю загальну конвенцію для позначення учасників реакції, чиї структури не витягнуті на малюнку.
Біологічна активність багатьох білків регулюється протеїнкіназами. У реакції протеїнкінази гідроксильні групи бічних ланцюгів на серинних, треонінових або тирозинних залишках деяких білків фосфорилюються АТФ:
Перетворення нейтральної гідроксильної групи в заряджений фосфат являє собою дуже різку зміну локальної архітектури білка, потенційно змінюючи його складаний малюнок і здатність зв'язуватися з малими молекулами або іншими білками. Біологічну функцію білка можна «увімкнути» фосфорилуванням одного залишку та знову вимкнути шляхом видалення фосфатної групи. Останню реакцію ми розглянемо далі в цьому розділі.
- Треонін кіназа каталізує фосфорилювання бічної ланцюгової гідроксильної групи залишків треоніну в білках. Намалюйте структуру, включаючи конфігурацію всіх стереоцентрів, залишку фосфотреоніну. Поясніть, як можна передбачити стереохімію бічного ланцюга.
Хоча стереохімічна інверсія при перенесенні фосфатів прогнозується теорією, той факт, що фосфатні групи є ахіральними, унеможливив тривалий час перевірити явище безпосередньо. Нарешті це було досягнуто наприкінці 1970-х років, коли група дослідників продемонструвала інверсію фосфату в ферментах кінази за допомогою хімічно синтезованого АТФ, в якому три різних ізотопи кисню були включені в g-фосфат, створюючи таким чином хіральний фосфорний центр. (Енн. Преподобний Біохім. 1980 49, 877).
Спирти можуть бути перетворені в органічні дифосфати двома різними способами. Двоетапний процес просто включає послідовні передачі g-фосфатних груп двох донорів АТФ, наприклад, на цих послідовних етапах біосинтезу ізопреноїдів. (СЕК. 2.7.1.36; СЕК. 2.7.4.2). Сполука під назвою мевалонат дифосфорилюється таким чином на ранній фазі біосинтетичного шляху холестерину, стероїдних гормонів та інших ізопреноїдних молекул.
Механізм першого етапу фосфорилювання аналогічний тому, що для реакції спиртокінази, яку ми щойно бачили. На другому етапі перенесення фосфатів, каталізованому окремим ферментом, один з фосфатних киснів на органічному монофосфаті діє як акцептор нуклеофільного фосфату, атакуючи g-фосфат другого АТФ.
У деяких метаболічних шляхах дифосфорилювання відбувається за іншим механізмом, ніж вище. замість послідовного перенесення двох фосфатів від двох донорів АТФ альтернативний механізм відбувається в один етап: молекула нуклеофільного акцептора атакує b-фосфат АТФ, а не g-фосфат. Після утворення тригонального біпірамідного проміжного продукту, це AMP (НЕ АДФ), який виганяється, і те, що почалося як b і g фосфати АТФ обидва залишаються з акцептором.
У біосинтезі нуклеотидів ДНК і РНК одна з гідроксильних груп на рибозо-5-фосфаті дифосфорилюється (ЕС 2.7.6.1) в одноступінчатому механізмі:
Одноетапна реакція дифосфорилювання спирту (PRPP синтаза):
Метаболічна роль обох процесів дифосфорилювання, які ми щойно бачили, полягає в перетворенні гідроксильної групи в хорошу групу, що залишають (нагадаємо, що гідроксидні іони є сильними основами і поганими групами виходу, тоді як фосфати/дифосфати, особливо при стабілізації в активному місці ферменту, є слабкими підставами і дуже хорошими залишаючи групи). У шляхах біосинтезу нуклеозидів дифосфатна група PRPP діє як вихідна група на найближчій метаболічній стадії, яка є\(S_N1\) реакцією: цю реакцію ми вже бачили в розділі 8.7).