Skip to main content
LibreTexts - Ukrayinska

3.6: білкові домени, мотиви та складки в білковій структурі

  1. Last updated
  2. Save as PDF
  • Page ID
    6194

    • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

    Структури двох різних білків, показані нижче, мають загальний домен PH (Pleckstrin Homology) (темно-бордовий).

    clipboard_e9234bb58d531bbfd5899db09937cc981.png

    Ці два та багато інших білків мають цей домен, що дозволяє їм зв'язувати молекулу фосфатидил-інозитол-трифосфату, яка генерується як частина загального клітинного сигнального шляху. Наслідком цього загального домену є те, що клітина може мати сигнальні шляхи, що дозволяють їй реагувати на різні сигнали, які призводять до однієї і тієї ж реакції, хоча і в різних умовах і, ймовірно, в різний час. Білки, як правило, описуються як складаються з декількох різних підструктур, розглянутих нижче.

    A. Домени

    Структурний домен - це елемент загальної структури білка, який є стабільним і часто складається незалежно від решти білкового ланцюга. Як і домен PH вище, багато доменів не є унікальними для білкових продуктів одного гена, а замість цього з'являються в різних білках. Білки, що поділяють більше, ніж кілька загальних доменів, кодуються членами еволюційно пов'язаних генів, що містять сімейства генів. Гени для білків, які поділяють лише один або кілька доменів, можуть належати до генних надсімейств. Члени суперсім'ї можуть мати одну спільну функцію, але їх послідовності інакше не пов'язані між собою. Доменні імена часто походять від їх видатної біологічної функції в білку, до якого вони належать (наприклад, кальцій-зв'язуючий домен кальмодуліну), або від їх першовідкривачів (домен PH!). Обмін доменами, що породжує сімейства генів та надродин, є природними генетичними подіями. Оскільки білкові домени також можуть бути «замінені» генною інженерією, щоб зробити химерні білки з новими функціями.

    137 Структура та функція домену білка

    Б. мотиви

    Білкові мотиви - це невеликі ділянки тривимірної структури білка або послідовності амінокислот, поділених між різними білками. Вони є впізнаваними областями білкової структури, які можуть (а можуть і не бути) визначені унікальною хімічною або біологічною функцією.

    C. Надвторинна структура

    Надвторинна структура відноситься до комбінації елементів вторинної структури, таких як бета-альфа-бета-одиниці або мотив спіралі спіралі. Їх також можна віднести до структурних мотивів. «Google» Супервторинна структура для прикладів.

    D. білкові складки

    Білкова складка відноситься до загального аспекту білкової архітектури, як спіральний пучок, бета-барель, складка Россмана або інші «складки», надані в базі даних структурної класифікації білків. Клацніть «Білкові складки», щоб дізнатися більше про ці структури.