16.7: Підсумковий звіт лабораторії

Last updated
Save as PDF

Page ID: 4166

\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

Мета дослідження нашого класу полягає у визначенні того, чи можуть ортологи S. pombe з генів S. cerevisiae MET доповнювати дефіцит штамів S. cerevisiae. Протягом семестру ви збирали дані та впорядковували дані в цифри та таблиці. Ці чернетки будуть зібрані в остаточний звіт. Дані, сподіваємось, утворюють гарну історію, яка відповідає на ваше дослідницьке запитання та/або пропонує додаткові експерименти.

Підсумковий звіт повинен бути у вигляді наукової публікації, яка включає в себе нумеровані нижче розділи. На відміну від міні-звітів, розділи «Результати» та «Обговорення» у підсумковому звіті повинні бути окремими. Коли ви пишете, майте на увазі, що гарне наукове письмо є точним і лаконічним! У професійному світі журнали забезпечують економічний стимул для стислості, стягуючи плату за сторінку з авторів - чим довше звіт, тим вище вартість сторінки для авторів! Будьте уважні, дотримуйтесь максимальну кількість сторінок для кожного розділу.

Експерименти для включення до підсумкового звіту включають:

Зростання ваших штамів на селективних середовищах
ПЛР колонії дріжджів
Карта обмежень вашої надмірної експресії плазмід
Репліки пластин трансформованих штамів
SDS-PAGE та західний блот аналіз клітинних екстрактів
Незалежний експеримент (поміщається там, де найбільш доцільно в тексті)

Ви можете вирізати та вставити з ваших попередніх мікрозвітів. Адже це ваша робота, і ви можете її відтворити! Коли ви робите це, радимо включити пропозиції вашої ЦА для покращення презентації. Єдині дані, які слід включити до підсумкового звіту, - це дані, які створила ваша команда. Не слід включати дані експериментів, які були розміщені іншими студентами на сайті обміну даними.

ТИТУЛЬНА СТОРІНКА

Включіть назву та анотацію, а також ваше ім'я та призначення розділу

1. Назва - Опишіть свій проект в 150 символів або менше.

2. Анотація (1 абзац, максимум 150 слів) - Одиночний інтервал
Анотація - це дуже короткий зміст вашої роботи, яке повинно бути зрозуміле неексперту. Анотація повинна включати цілі ваших експериментів, деяку згадку (не опис) методів, що використовуються в експериментах, стислий підсумок ваших експериментальних результатів та ваші загальні висновки. Уникайте конкретних деталей експериментів. Читач повинен вміти читати анотацію та розуміти загальний експеримент та результати, не читаючи решту звіту. Складіть реферат ПІСЛЯ завершення решти звіту.

ТІЛО ЗВІТУ - подвійний інтервал (Зверніть увагу, що це відрізняється від анотації.)

3. Вступ (1,5-2 сторінки)
Вступ надає контекст для ваших експериментів. Яка мета ваших експериментів? Як ваш експеримент вписується в те, що вже відомо про вашу тему? Хто-небудь робив експерименти, схожі на ваші раніше? Щоб відповісти на ці питання, вступ надає читачеві відповідну довідкову інформацію, отриману з наукової літератури. Обговоріть функцію ферменту та його еволюційне збереження. Використовуйте формат дослідження дріжджів FEMS, щоб вставити цитати у свій звіт. Включіть щонайменше 7 цитат з наукової літератури.

В останньому абзаці вступу надайте читачеві попередній перегляд вашого звіту. Розкажіть читачеві, які експериментальні підходи ви використовували, щоб відповісти на своє запитання. Закінчіть цей розділ одним або двома реченнями, що підсумовують ваші висновки.

4. Матеріали та методи (2-3 сторінки)
Протягом семестру ви використовували різноманітні методики, які були предметом ваших мікрозвітів. У публікаціях розділ M&M зазвичай ділиться на підрозділи, часто з власними підзаголовками, що відображають різні експерименти та методи.

Перший абзац у розділі M & M часто містить деталі про організми, що використовуються в експериментах, та умови їх культури. Коли для експериментів використовуються дріжджі та інші мікроорганізми, часто включається таблиця генотипів. Включіть таблицю генотипу з таблицею з інформацією про штами та плазміду як таблицю 1. Зверніться до Корденте та ін. (2009) для гарного прикладу. Включіть три штами YMP, з якими ви працювали на початку семестру в цій таблиці. Наші штами YMP були отримані від штаму BY4742, який має генотип Matα his3∆1 leu2Δ0 ura3∆0. Кожен з штамів YMP має зустрівну делецію, викликану введенням гена KAN ^R. На алелі вилучення зустрілися слід посилатися як: met#:: KAN ^R. (Див. Розділ 6.)

Плазміди для цього звіту базуються на PyES2.1 та PbG1805, обидва з яких приводять вираз за допомогою промотора GAL1. Щоб описати ці плазміди надмірної експресії, скористайтеся форматом:

ПБГ1805- ГАЛ 1: МЕТ# або ПІЕС2.1- Гал1: Мет#

Коротко підсумуємо методи, використовувані в експериментах з відповідними підзаголовками. Не соромтеся вирізати і вставляти з попередніх мікрозвітів. Додайте додаткову інформацію для самостійного експерименту. Пам'ятайте - якщо ви використовуєте опубліковану техніку (або реагент), вам не потрібно повторювати всі подробиці в розділі M&M. Натомість ви можете звернутися до опублікованої процедури або формулювання. У цьому курсі ви можете звернутися до протоколу в лабораторному посібнику, але вам потрібно включити будь-які зміни, які ви внесли до процедур або рецептів.

Емпіричне правило: Хороший розділ M & M повинен надавати достатньо інформації для навченого professional, щоб відтворити ваші експерименти.

5. Результати - (2-3 сторінки, не включаючи таблиці та малюнки)
Розділ «Результати» розповідає історію. Він надає короткий розповідь, який направляє читача через малюнки та таблиці з даними. Плавні переходи важливі в розділі Результати. Читач повинен вміти зрозуміти міркування, які привели від одного експерименту до іншого. НЕ обговорюйте результати будь-якої глибини в цьому розділі - в цьому звіті є окремий розділ обговорення. Надайте достатньо своїх висновків про те, що перехід до наступного експерименту є логічним. Наприклад, ваші дані селективного покриття вплинули на ваш вибір праймерів для експерименту з ПЛР колонії дріжджів. (Ваші таблиці насправді включають деякі з цих висновків.) Оскільки в роботі часто використовуються різні види експериментів, автори часто використовують підзаголовки в розділі «Результати».

На малюнках і таблицях з мікрозвітів повинні бути наведені цифри, які відповідають порядку їх появи в тексті. РОЗМІСТІТЬ цифри та таблицю в розділі Результати ПОРУЧ , де на них посилаються. (Через розриви сторінок не завжди можливо розмістити малюнок або таблицю на тій же сторінці, на яку вона посилається. НЕ просто прикріплюйте таблиці та малюнки до кінця звіту. У документі Cordente et al. (2009) наведено приклади нумерації та розміщення. Дотримуйтесь загальних рекомендацій щодо мікрозвітів. Пам'ятайте, що навчений біолог повинен вміти розуміти ваші результати, просто «дивлячись на фотографії».

6. Обговорення - максимум 2 сторінки
Наша мета цього семестру полягала в тому, щоб визначити, чи були збережені функції білка Met між

S. cerevisiae і S. pombe, використовуючи комплементацію для аналізу білкової функції. Під час написання цього звіту вирішуйте наступні питання:

Чи спостерігали ви будь-які відмінності в здібностях генів S. cerevisiae та S. pombe доповнювати зустрівши мутацію у вашому штамі? Чи відповідають ваші дані про доповнення збереженню?
Узгодити дані про доповнення з результатами SDS-PAGE та western blot. Чи були Met білки очікуваного розміру виражені в трансформованих клітині? Як комплементація відноситься до експресії білка Met?
Якщо ви не спостерігали доповнення, це було через технічні проблеми або через розбіжність білка між двома дріжджами? Як би ви це перевірили?
Як ваш незалежний експеримент підтвердив або продовжив ваші результати?
Які додаткові експерименти слід зробити, щоб довести науковому співтовариству, що функція MetXP є/не зберігається між двома видами дріжджів?

7. References -
Перелічіть посилання з одним інтервалом, використовуючи формат дослідження дріжджів FEMS, як це було в призначенні бібліографії.