10.S: Вступ до моделей народження-смерті (резюме)

Last updated
Save as PDF

Page ID: 4328

\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

У цьому розділі я представив моделі народження-смерть і узагальнив їх основні математичні властивості. Моделі народження-смерті передбачають закономірності видового різноманіття за часовими інтервалами, а також можуть бути використані для моделювання росту філогенетичних дерев. Ми можемо візуалізувати ці закономірності, вимірюючи рівновагу дерева та створюючи графіки лінійного часу (LTT).

Посилання

Бейлі, Н. Дж. 1964. Елементи стохастичних процесів з додатками до природничих наук. Джон Вілі та сини.

Белл, К.Д., Д. Е. Солтіс, і П.С. Солтіс. 2005. Вік покритонасінних рослин: молекулярна шкала часу без годинника. Еволюція 59:1245 —1258 рр.

Коллесс, Д. Х. 1982. Огляд філогенетики: Теорія та практика філогенетичної систематики. Сист. Зоол.

Крепет, В.Л., і К.Дж. Ніклас. 2009 рік. Друга «гидотна таємниця» Дарвіна: Чому існує так багато покритонасінних видів? Ам. Дж. бот. Ботанічна Сок Америка.

Девіс, Т. Дж., Барракло, М.В. Чейз, П. С. Солтіс, Д. Е. Солтіс, і В.Саволайнен. 2004. Огидна таємниця Дарвіна: Висновки з наддерева покритонасінних рослин. Проц. Наталь. Акад. науковий. У. С. А. 101:1904 —1909.

Фарріс, Дж. 1976. Очікувана асиметрія філогенетичних дерев. Сист. Зоол. 25:196 —198. [Преса Оксфордського університету, Товариство систематичних біологів, Тейлор і Френсіс, Ltd.].

Фельзенштейн, Дж. 2004. Виведення філогеній. Sinauer Associates, Inc., Сандерленд, Массачусетс

Фут, М., Дж.П. Хантер, К.М. Яніс, і Дж. Сепкоскі молодший 1999. Еволюційні та консерваційні обмеження походження біологічних груп: часи дивергенції евтеріанових ссавців. Наука 283:1310 —1314.

Хеджес, С.Б., Дадлі, і С.Кумар. 2006. TimeTree: Громадська база знань про часи розбіжності між організмами. Біоінформатика 22:2971 —2972.

Кот, М. 2001. Стохастичні процеси народження і смерті. С. 25—42 у М.Кот, за ред. Елементи математичної екології. Кембриджський університетський прес, Кембридж.

Мурс, А.О., і С.Б. Херд. 1997. Виведення еволюційного процесу з філогенетичної форми дерева. К. преподобний біол. 72:31 —54.

Рауп, Д.М. 1985. Математичні моделі кладогенезу. Палеобіологія 11:42 —52.

Словінський, Дж. Б., і К.Гуйєр. 1993. Тестування, чи викликали певні риси посилену диверсифікацію: вдосконалений метод, заснований на моделі випадкового видоутворення та вимирання. Ам. Нат. 142:1019 —1024.

Стадлер, Т. 2011. Імітація дерев з фіксованою кількістю збереглися видів. Сист. Біол. 60:676 —684.