Skip to main content
LibreTexts - Ukrayinska

1.5: Огляд книги

  1. Last updated
  2. Save as PDF
  • Page ID
    4407

    • \( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)

    У цій книзі я окреслив статистичні процедури аналізу порівняльних даних. Деякі методи - такі як методи оцінки закономірностей видоутворення та вимирання через час - вимагають ультраметричного філогенетичного дерева. Інші підходи моделюють еволюцію ознак, і, таким чином, вимагають даних про ознаки видів, які входять до складу філогенетичного дерева. Методи також відрізняються щодо того, чи вимагають вони філогенетичне дерево бути повним - тобто включати кожен живий вид, що походить від певного предка, або може вмістити меншу вибірку живих видів.

    Книга починається із загального обговорення модельних підходів до статистики (Глава 2), з особливим акцентом на максимальній ймовірності та байєсівських підходах. У розділах 3-9 я описую моделі еволюції персонажів. Я обговорюю підходи до моделювання та аналізу еволюції цих персонажів на дереві. Глави 10-12 присвячені моделям диверсифікації, які описують закономірності видоутворення та вимирання через час. Я описую методи, які дозволяють моделювати і пристосувати ці моделі до порівняльних даних. Глава 13 охоплює комбінований аналіз еволюції характеру та диверсифікації родознавства. Нарешті, у розділі 14 я обговорюю те, що ми дізналися досі про еволюцію цих підходів, і що ми, ймовірно, дізнаємось у майбутньому.

    Існує ряд комп'ютерних програмних засобів, які можуть бути використані для виконання описаних тут способів. У цій книзі я зосереджуюся на статистичному програмному середовищі R. Для кожної глави мій веб-сайт курсу, в процесі, надає зразок коду R, який може бути використаний для проведення всіх описаних аналізів. Сподіваюся, що цей R код дозволить подальший розвиток цієї мови для порівняльного аналізу. Однак алгоритми, які ми описуємо, можна виконувати за допомогою інших комп'ютерних програм або мов програмування (наприклад, Arbor, http://www.arborworkflows.com).

    Статистичні порівняльні методи представляють перспективне майбутнє еволюційних досліджень, тим більше, що наші знання про дерево життя розширюються. Сподіваюся, що методи, описані в цій книзі, можуть служити розеттським каменем, який допоможе нам читати дерево життя в міру його побудови.