4.E: Вправи генетичного інструментарію
- Page ID
- 3370
Журнальний клуб
Цього тижня читання - це три звички високоефективних сигнальних шляхів
Читання питань керівництва
Сигналізація перевертає перемикач
1. Які три звички сигнальних шляхів?
2. Що таке SPRE і яке це значення в сигнальних шляхах?
3. Яка може бути метою експериментальної активації сигнального шляху?
Недостатність активатора
4. Визначити активаторну недостатність і зони компетенції
5. Як автори пояснюють висновок про те, що SPREs недостатні in vitro, але достатні в культивованих клітині?
Кооперативна активація
6. Що таке сигнально-незалежний активатор?
7. Яке призначення коактиваторів?
Репресії за замовчуванням
8. Як розвиваються організми вирішують проблему негерметичного вираження?
9. Порівняйте два типи репресій за замовчуванням і те, як сигналізація звільняє репресії
Функціональні/механістичні/еволюційні міркування
10. Яку роль відіграє модифікація хроматину в розробці каскадів трансдукції сигналу?
Дискусійні питання класу
Сигналізація перевертає перемикач
1. Вибрав одну звичку ілюструвати малюнком.
2. Поясніть, як Notch, Wnt і Hh виконують транскрипційне перемикання.
Недостатність активатора
3. Що мають на увазі автори, коли говорять, що сигнальні шляхи демонструють «селективну транскрипційну чуйність генів-мішеней до активності шляхів».?
4. Якими способами клітини можуть обмежувати активацію гена-мішені активованим сигнальним шляхом?
Кооперативна активація
5. Який потенційний недолік кооперативної активації?
Репресії за замовчуванням
6. Проілюструйте різні типи репресій за замовчуванням
7. Проілюструйте один приклад репресій за замовчуванням
Функціональні/механістичні/еволюційні міркування
8. Поясніть Малюнок 5: як це короткий вивід звичок сигнального шляху?
9. Поясніть, як Koide et al перевіряли, чи є репресія за замовчуванням відокремлена від недостатності активатора.
Групова вправа
Ця діяльність HHMI досліджує еволюцію cis-регуляторних елементів. Ви можете виконати вправу, не переглядаючи запропонований фільм (доступний на YouTube та веб-сайті HHMI).
Моделювання регуляторних перемикачів гена Pitx1 у риб-колючок