2.3: Вуглець
- Page ID
- 1427
Навички для розвитку
- Поясніть, чому вуглець важливий для життя
- Охарактеризуйте роль функціональних груп у біологічних молекулах
Клітини складаються з багатьох складних молекул, які називаються макромолекулами, таких як білки, нуклеїнові кислоти (РНК та ДНК), вуглеводи та ліпіди. Макромолекули - це підмножина органічних молекул (будь-яка вуглецевмісна рідина, тверда речовина або газ), які особливо важливі для життя. Основним компонентом для всіх цих макромолекул є вуглець. Атом вуглецю має унікальні властивості, які дозволяють йому утворювати ковалентні зв'язки до цілих чотирьох різних атомів, що робить цей універсальний елемент ідеальним для того, щоб служити основним структурним компонентом або «кісткою» макромолекул.
Окремі атоми вуглецю мають неповну зовнішню електронну оболонку. При атомному номері 6 (шість електронів і шість протонів) перші два електрони заповнюють внутрішню оболонку, залишаючи чотири в другій оболонці. Тому атоми вуглецю можуть утворювати до чотирьох ковалентних зв'язків з іншими атомами, щоб задовольнити правило октету. Молекула метану наводить приклад: вона має хімічну формулу CH 4. Кожен з чотирьох атомів водню утворює єдину ковалентну зв'язок з атомом вуглецю, розділяючи пару електронів. Це призводить до заповнення крайньої зовнішньої оболонки.
Вуглеводні
Вуглеводні - це органічні молекули, що складаються повністю з вуглецю і водню, таких як метан (CH 4), описаний вище. Ми часто використовуємо вуглеводні в нашому повсякденному житті як паливо - як пропан у газовому грилі або бутан у запальничці. Багато ковалентні зв'язки між атомами в вуглеводнях зберігають велику кількість енергії, яка виділяється при спалюванні (окисленні) цих молекул. Метан, відмінне паливо, є найпростішою молекулою вуглеводню, з центральним атомом вуглецю, зв'язаним з чотирма різними атомами водню, як показано на малюнку\(\PageIndex{1}\). Геометрія молекули метану, де атоми мешкають в трьох вимірах, визначається формою її електронних орбіталей. Вуглеці та чотири атоми водню утворюють форму, відому як тетраедр, з чотирма трикутними гранями; з цієї причини метан описується як чотиригранну геометрію.

Як основа великих молекул живих істот, вуглеводні можуть існувати у вигляді лінійних вуглецевих ланцюгів, вуглецевих кілець або комбінацій обох. Крім того, окремі вуглецево-вуглецеві зв'язки можуть бути одинарними, подвійними або потрійними ковалентними зв'язками, і кожен тип зв'язку впливає на геометрію молекули певним чином. Ця тривимірна форма або конформація великих молекул життя (макромолекул) має вирішальне значення для того, як вони функціонують.
вуглеводневі ланцюги
Вуглеводневі ланцюги утворені послідовними зв'язками між атомами вуглецю і можуть бути розгалуженими або нерозгалуженими. Крім того, загальна геометрія молекули змінюється різними геометріями одинарних, подвійних та потрійних ковалентних зв'язків, проілюстрованих на малюнку\(\PageIndex{2}\). Вуглеводні етан, етен та етин служать прикладами того, як різні вуглецево-вуглецеві зв'язки впливають на геометрію молекули. Назви всіх трьох молекул починаються з префікса «eth-», який є префіксом для двох вуглеводнів. Суфікси «-ane», «-ene» і «-yne» відносяться до наявності одинарних, подвійних або потрійних вуглецево-вуглецевих зв'язків відповідно. Таким чином, пропан, пропен та пропін дотримуються тієї ж картини з трьома молекулами вуглецю, бутану, бутану та бутину для чотирьох молекул вуглецю тощо. Подвійні і потрійні зв'язки змінюють геометрію молекули: поодинокі зв'язки допускають обертання уздовж осі зв'язку, тоді як подвійні - до плоскої конфігурації, а потрійні - до лінійної. Ці геометрії мають значний вплив на форму, яку може припустити конкретна молекула.

Вуглеводневі кільця
Поки що розглянуті нами вуглеводні були аліфатичними вуглеводнями, які складаються з лінійних ланцюгів атомів вуглецю. Інший вид вуглеводнів, ароматичні вуглеводні, складається із замкнутих кілець атомів вуглецю. Кільцеві структури зустрічаються в вуглеводнях, іноді з наявністю подвійних зв'язків, що можна побачити, порівнявши структуру циклогексану з бензолом на рис\(\PageIndex{3}\). Приклади біологічних молекул, які включають бензольне кільце, включають деякі амінокислоти та холестерин та його похідні, включаючи гормони естроген та тестостерон. Бензольне кільце також міститься в гербіциді 2,4-Д. Бензол є природним компонентом сирої нафти і був класифікований як канцероген. Деякі вуглеводні мають як аліфатичну, так і ароматичну порції; бета-каротин є прикладом такого вуглеводню.

Ізомери
Тривимірне розміщення атомів та хімічних зв'язків всередині органічних молекул є центральним для розуміння їх хімії. Молекули, які мають однакову хімічну формулу, але відрізняються розміщенням (структурою) своїх атомів та/або хімічних зв'язків, відомі як ізомери. Структурні ізомери (як бутан і ізобутен, показані\(\PageIndex{4}\) на малюнку а) відрізняються розміщенням їх ковалентних зв'язків: обидві молекули мають чотири вуглецю і десять воднів (C 4 H 10), але різне розташування атомів всередині молекул призводить до відмінностей в їх хімічні властивості. Наприклад, завдяки своїм різним хімічним властивостям бутан підходить для використання в якості палива для запальничок і факелів, тоді як ізобутен підходить для використання в якості холодоагенту і палива в балончиках з розпилювачем.
Геометричні ізомери, з іншого боку, мають подібні місця розташування своїх ковалентних зв'язків, але відрізняються тим, як ці зв'язки створюються з навколишніми атомами, особливо в подвійних зв'язках з вуглецем до вуглецю. У простій молекулі бутену (C 4 H 8) дві метильні групи (CH 3) можуть бути по обидва боки подвійного ковалентного зв'язку центральної молекули, як показано на малюнку\(\PageIndex{4}\) b Коли вуглеці пов'язані на одній стороні подвійного зв'язку, це цис конфігурація; якщо вони знаходяться з протилежних сторін подвійного зв'язку, це транс-конфігурація. У транс-конфігурації вуглеці утворюють більш-менш лінійну структуру, тоді як вуглеці в конфігурації cis роблять вигин (зміна напрямку) вуглецевої магістралі.
Мистецтво З'єднання

Яке з наведених нижче тверджень є помилковим?
- Молекули з формулами СН 3 СН 2 СООН і С 3 Н 6 О 2 могли бути структурними ізомерами.
- Молекули повинні мати подвійний зв'язок, щоб бути цис-транс-ізомерами.
- Щоб бути енантіомерами, молекула повинна мати принаймні три різні атоми або групи, з'єднані з центральним вуглецем.
- Щоб бути енантіомерами, молекула повинна мати принаймні чотири різних атоми або групи, з'єднані з центральним вуглецем.
У тригліцеридах (жирах і маслах) довгі вуглецеві ланцюги, відомі як жирні кислоти, можуть містити подвійні зв'язки, які можуть бути або в цис, або в транс-конфігурації, проілюстровані на малюнку\(\PageIndex{5}\). Жири, що мають принаймні одну подвійну зв'язок між атомами вуглецю, є ненасиченими жирами. Коли деякі з цих зв'язків знаходяться в конфігурації cis, отриманий вигин у вуглецевій кістці ланцюга означає, що молекули тригліцеридів не можуть щільно упакувати, тому вони залишаються рідкими (маслом) при кімнатній температурі. З іншого боку, тригліцериди з транс-подвійними зв'язками (в народі їх називають транс-жирами) мають відносно лінійні жирні кислоти, які здатні щільно упаковуватися при кімнатній температурі і утворювати тверді жири. У раціоні людини трансжири пов'язані з підвищеним ризиком серцево-судинних захворювань, тому багато виробників продуктів харчування зменшили або виключили їх вживання в останні роки. На відміну від ненасичених жирів, тригліцериди без подвійних зв'язків між атомами вуглецю називаються насиченими жирами, що означає, що вони містять всі наявні атоми водню. Насичені жири являють собою тверду речовину кімнатної температури і зазвичай тваринного походження.

енантіомери
Енантіомери - це молекули, які мають однакову хімічну структуру та хімічні зв'язки, але відрізняються тривимірним розміщенням атомів так, що вони є дзеркальними зображеннями. Як показано на малюнку\(\PageIndex{6}\), на прикладі амінокислоти аланін, дві структури є непереборними. У природі для виготовлення білків використовуються тільки L-форми амінокислот. Деякі D-форми амінокислот спостерігаються в клітинних стінках бактерій, але ніколи в їх білках. Аналогічно, D-форма глюкози є основним продуктом фотосинтезу і L-форма молекули рідко зустрічається в природі.

Функціональні групи
Функціональні групи - це групи атомів, які відбуваються всередині молекул і надають цим молекулам специфічні хімічні властивості. Вони знаходяться уздовж «вуглецевого хребта» макромолекул. Ця вуглецева магістраль утворена ланцюгами та/або кільцями атомів вуглецю з випадковою заміною такого елемента, як азот або кисень. Молекули з іншими елементами в їх вуглецевій магістралі є заміщеними вуглеводнями.
Функціональні групи макромолекули зазвичай прикріплюються до вуглецевої магістралі в одному або декількох різних місцях уздовж її ланцюга та/або кільцевої структури. Кожен з чотирьох типів макромолекул - білки, ліпіди, вуглеводи та нуклеїнові кислоти - має свій характерний набір функціональних груп, що значною мірою сприяє його різним хімічним властивостям та його функції в живих організмах.
Функціональна група може брати участь в специфічних хімічних реакціях. Деякі важливі функціональні групи в біологічних молекулах показані на малюнку\(\PageIndex{7}\); вони включають: гідроксил, метил, карбоніл, карбоксил, аміно, фосфат і сульфгідрил. Ці групи відіграють важливу роль у формуванні таких молекул, як ДНК, білки, вуглеводи та ліпіди. Функціональні групи зазвичай класифікуються як гідрофобні або гідрофільні залежно від їх характеристик заряду або полярності. Прикладом гідрофобної групи є неполярна молекула метану. Серед гідрофільних функціональних груп - карбоксильна група, що міститься в амінокислотах, деяких бічних ланцюгах амінокислот та жирних кислот, що утворюють тригліцериди та фосфоліпіди. Ця карбоксильна група іонізується, щоб вивільнити іони водню (H +) з групи COOH, що призводить до негативно зарядженої COO - групи; це сприяє гідрофільній природі будь-якої молекули, на якій вона знаходиться. Інші функціональні групи, такі як карбонільна група, мають частково негативно заряджений атом кисню, який може утворювати водневі зв'язки з молекулами води, знову роблячи молекулу більш гідрофільною.

Водневі зв'язки між функціональними групами (всередині однієї молекули або між різними молекулами) важливі для функції багатьох макромолекул і допомагають їм правильно складатися і підтримувати відповідну форму для функціонування. Водневі зв'язки також беруть участь у різних процесах розпізнавання, таких як сполучення доповнюючої основи ДНК та зв'язування ферменту з його субстратом, як показано на малюнку\(\PageIndex{8}\).

Резюме
Унікальні властивості вуглецю роблять його центральною частиною біологічних молекул. Вуглець зв'язується з киснем, воднем та азотом ковалентно, утворюючи багато молекул, важливих для клітинної функції. Вуглець має чотири електрони в своїй зовнішній оболонці і може утворювати чотири зв'язку. Вуглець і водень можуть утворювати вуглеводневі ланцюги або кільця. Функціональні групи - це групи атомів, які надають специфічні властивості вуглеводневим (або заміщеним вуглеводневим) ланцюгам або кільцям, що визначають їх загальні хімічні характеристики та функції.
Мистецькі зв'язки
Малюнок\(\PageIndex{4}\): Яке з наведених нижче тверджень є помилковим?
- Молекули з формулами СН 3 СН 2 СООН і С 3 Н 6 О 2 могли бути структурними ізомерами.
- Молекули повинні мати подвійний зв'язок, щоб бути цис - транс-ізомерами.
- Щоб бути енантіомерами, молекула повинна мати принаймні три різні атоми або групи, з'єднані з центральним вуглецем.
- Щоб бути енантіомерами, молекула повинна мати принаймні чотири різних атоми або групи, з'єднані з центральним вуглецем.
- Відповідь
-
C
Глосарій
- аліфатичний вуглеводневий
- вуглеводню, що складається з лінійного ланцюга атомів вуглецю
- ароматичний вуглеводневий
- вуглеводню, що складається з замкнутих кілець атомів вуглецю
- енантіомери
- молекули, які поділяють загальну структуру та схеми зв'язку, але відрізняються тим, як атоми розміщуються в трьох вимірах таким чином, що вони є дзеркальним відображенням один одного
- функціональна група
- група атомів, яка забезпечує або надає певну функцію вуглецевому скелету
- геометричний ізомер
- ізомер зі схожими схемами зв'язку, що відрізняються розміщенням атомів поряд з подвійним ковалентним зв'язком
- вуглеводнів
- молекула, яка складається тільки з вуглецю і водню
- ізомери
- молекули, які відрізняються один від одного, хоча вони мають однакову хімічну формулу
- органічна молекула
- будь-яка молекула, що містить вуглець (крім вуглекислого газу)
- структурні ізомери
- молекули, які поділяють хімічну формулу, але відрізняються розміщенням своїх хімічних зв'язків
- заміщений вуглеводневий
- вуглеводневий ланцюг або кільце, що містить атом іншого елемента замість одного з магістральних вуглеводів