19.2G: Швидка ідентифікація мікроорганізмів
- Page ID
- 5652
\( \newcommand{\vecs}[1]{\overset { \scriptstyle \rightharpoonup} {\mathbf{#1}} } \) \( \newcommand{\vecd}[1]{\overset{-\!-\!\rightharpoonup}{\vphantom{a}\smash {#1}}} \)\(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \(\newcommand{\id}{\mathrm{id}}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\) \( \newcommand{\kernel}{\mathrm{null}\,}\) \( \newcommand{\range}{\mathrm{range}\,}\) \( \newcommand{\RealPart}{\mathrm{Re}}\) \( \newcommand{\ImaginaryPart}{\mathrm{Im}}\) \( \newcommand{\Argument}{\mathrm{Arg}}\) \( \newcommand{\norm}[1]{\| #1 \|}\) \( \newcommand{\inner}[2]{\langle #1, #2 \rangle}\) \( \newcommand{\Span}{\mathrm{span}}\)
Потреба
- діагностика інфекції, щоб можна було розпочати відповідне лікування (наприклад, антибіотик).
- тестування їжі, щоб переконатися, що вона не забруднена інфекційними організмами, такими як кишкова паличка O157: H7 та Salmonella enterica
- виявити такий біологічний агент, як сибірська виразка та віспа, в можливому теракті, щоб швидко вжити відповідних заходів
Методи
Культурне
- Найстаріший і до сих пір найпоширеніший.
- Для бактерій розподіліть зразки на культуральних середовищах і досліджуйте отримані колонії на морфологічні та метаболічні ознаки. Для вірусів прищеплюють культури живих клітин.
- Недолік: це займе кілька днів, щоб дізнатися результати.
Полімеразна ланцюгова реакція (ПЛР)
- Витягніть ДНК із зразка і проведіть ПЛР.
- Перевага: швидке (часто менше години)
- Недолік: надмірно чутливий до присутності забруднень
Імуноаналізи
Використовуйте метод, який експлуатує специфічність і чутливість реакції між антигеном і антитілами. Займає 15 хвилин або довше.
Біосенсори (CANARY)
У випуску журналу Science від 11 липня 2003 року група вчених лабораторії Лінкольна в США повідомила про новий метод швидкої ідентифікації, який експлуатує живі клітини. Вони називають свій метод CANARY (для C-клітинного аналізу A та N-сповіщення про ризики R та Y поля)
Їх «біосенсор» - це клон В-лімфоцитів (В-клітин), які були генетично сконструйовані для експресії
- В-клітинний рецептор антигену (BCR), обраний для взаємодії з епітопом на підозрюваному агенті. BCR на їх клони - це поверхневий IgM.
- AEQUORIN, білок, витягнутий з тієї ж медузи, яка виробляє зелений флуоресцентний білок.
- Аеккорин випромінює світло, коли він піддається впливу іонів кальцію (Ca 2+).
- Одним з перших подій (протягом декількох секунд), коли БЦР зв'язуються з антигеном, є підвищення рівня іонів кальцію в цитозолі.
Порядок дій:
- Підготуйте зразок.
- Змішайте - в окремих лунках - з клонами В-клітин кожен специфічний для різного підозрюваного агента.
- Помістіть в чутливий детектор світла.
- Якщо клон має BCR для епітопу, присутнього у зразку, цей клон випромінює світло протягом декількох секунд.
Результати:
- високочутливий: може виявити лише 50 бактерій або 500 віріонів
- високоспецифічний: може виявити агент навіть у присутності супутніх забруднюючих речовин.
- швидко: час, що минув від підготовки зразка до сигналу від детектора світла, часто становить менше 5 хвилин.
