6.6: Виражені теги послідовності
- Page ID
- 5807
Лише дуже малий відсоток (1,2% у людей) ДНК в геномах хребетних кодує білки («протеом»), оскільки екзони більшості генів розділені набагато довшими інтронами між нашими генами лежать величезні кількості ДНК, значна частина яких, здається, регулює експресію наших генів, але не транскрибується і перекладається в білковий продукт. Тож навіть коли відома повна послідовність генома, часто важко визначити певні гени (відкриті кадри читання або ORF).
Один з підходів до вирішення проблеми полягає в дослідженні транскриптом організму. Найчастіше це визначається як: Усі молекули месенджерної РНК (мРНК) транскрибуються з генома. Це «a» транскриптом, а не «транскриптом», оскільки те, які гени транскрибуються в клітині, залежить від виду клітини (наприклад, клітини печінки проти лімфоцитів) і того, що робить клітина в той час, наприклад,
- підготовка до ділення по мітозу;
- реагуючи на надходження гормону або цитокіну;
- готуючись до виділення білкового продукту.
Виражені теги послідовності (ESTS)
ЕСТ - це короткі (200—500 нуклеотидів) послідовності ДНК, які можуть бути використані для ідентифікації гена, який експресується в клітині в певний час.
Порядок дій:
- Ізолювати месенджерну РНК (мРНК) з певної тканини (наприклад, печінки)
- Лікують його за допомогою зворотної транскриптази. Зворотна транскриптаза - це ДНК-полімераза, яка використовує РНК як свій шаблон. Таким чином, він здатний змусити генетичну інформацію потік у зворотному (РНК -> ДНК) свого нормального напрямку (ДНК -> РНК).
- Це виробляє комплементарну ДНК (кДНК). Зверніть увагу, що кДНК відрізняється від нормального гена відсутністю інтронних послідовностей.
- Послідовність 200—500 нуклеотидів як на 5′, так і на 3′ кінцях кожної кДНК.
- Вивчіть базу даних генома організму, щоб знайти відповідну послідовність.